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[综合交流] 低共熔溶剂可以进行结构优化和分子表面静电势分析吗

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低共熔溶剂可以进行结构优化计算单点能并进行静电势分析吗?

低共熔溶剂是两固体化合物在加热条件下形成的熔融液体,其形成原理是两分子间形成氢键。二者分别作为氢键供体(HBD)和氢键受体(HBA)相结合。其作用原理如图1所示

我的低共熔溶剂是氯化胆碱:香豆酸=1:3组成,结构如图2,这样的复合物可以用gaussian进行结构优化计算单点能,并进行分子表面静电势分析吗?进行结构优化时复合物的结构应该怎么画呀,其电荷和自旋多重度怎么判断?我尝试用图3这样的结构,以b3lyp/6-31g** opt运行了好久没有结束,是哪里有问题吗?

在论坛内搜索低共熔溶剂似乎都是做分子动力学,不知道量化可不可行呀?

图1 低共熔溶剂作用原理.png (89.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

图1 低共熔溶剂作用原理

图1 低共熔溶剂作用原理

图2 氯化胆碱和香豆酸.png (46.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

图2 氯化胆碱和香豆酸结构

图2 氯化胆碱和香豆酸结构

图3.png (149.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

图3 我模拟的氯化胆碱:香豆酸1:3

图3 我模拟的氯化胆碱:香豆酸1:3

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发表于 Post on 2024-3-7 04:46:39 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP优化这个哪能不带色散校正、不带溶剂模型。“好久没有结束” 这种事自行监控计算

量子化学简简单单用这么个模型做优化意义不大,环境中的离子都没法确切表现出来,然而却又完全没法忽视

能不能做静电势分析完全看你的目的
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发表于 Post on 2024-4-3 17:33:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-7 04:46
B3LYP优化这个哪能不带色散校正、不带溶剂模型。“好久没有结束” 这种事自行监控计算

量子化学简简单单 ...

老师我也是做这个方向的,请问您的意思是高斯无法对这种体系进行优化和能量计算吗?

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发表于 Post on 2024-4-3 18:17:08 | 只看该作者 Only view this author
xiewei 发表于 2024-4-3 17:33
老师我也是做这个方向的,请问您的意思是高斯无法对这种体系进行优化和能量计算吗?

光用量子化学研究这种体系能给出的信息太有限,需要和分子动力学结合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-4-3 22:32:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-3 18:17
光用量子化学研究这种体系能给出的信息太有限,需要和分子动力学结合

那如果我只是通过计算结合能来筛选单体呢?

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