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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助请问大家如何在MS中正确表示苯甲基自由基?

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请问大家,我在Materials studio Dmol3模块中模拟自由基反应,上图是我建立的要参与反应的苯甲基自由基,但是我一选择自动成键,就成为下图所示情况,请问大家我该如何建立真正的苯甲基自由基?

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发表于 Post on 2022-4-1 14:36:42 | 只看该作者 Only view this author
显示成什么键无意义,坐标文件一般只记录原子坐标

看着不舒服的话你为什么要点自动成键呢。。。。本身就是苯甲基自由基了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-1 14:51:40 | 只看该作者 Only view this author
Eudaimonia 发表于 2022-4-1 14:36
显示成什么键无意义,坐标文件一般只记录原子坐标

看着不舒服的话你为什么要点自动成键呢。。。。本身就 ...

感谢,有一个问题这两个物质原子坐标一模一样,我该怎么确定参与反应的是苯甲基自由基,而不是另一种物质?我比较菜,还请指教,感谢!

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发表于 Post on 2022-4-1 15:43:42 | 只看该作者 Only view this author
南晓 发表于 2022-4-1 14:51
感谢,有一个问题这两个物质原子坐标一模一样,我该怎么确定参与反应的是苯甲基自由基,而不是另一种物质 ...

没事的,苯环上就没有“纯粹”的单键双键,只要坐标相同就是同一种物质。
http://sobereva.com/414
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-1 16:36:04 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-4-1 15:43
没事的,苯环上就没有“纯粹”的单键双键,只要坐标相同就是同一种物质。
http://sobereva.com/414

感谢感谢我去看看

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