请教如何构建吸附材料SAM，石墨烯等吸附材料的模型

azero · 发表于 Post on 2020-6-29 16:22:56

本帖最后由 azero 于 2020-6-29 16:40 编辑

之前一直是做蛋白类的模拟，然后打算做材料对蛋白的吸附。
作为一名小白，完全不知道该如何构建各种材料，MS这种也没用过。
打算建立石墨烯，氧化石墨烯，SAM膜（类似于论文的图），石墨烯的百度还是有一些教程，但SAM膜接上各种基团就有点蛋疼，请问有没有比较好的入门的教程？

sobereva · 发表于 Post on 2020-6-29 19:04:21

氧化石墨烯有现成的工具
https://github.com/Ngtungfei/Graphene-Oxide-Generator
https://github.com/aruth2/GOMonteCarlo

建立石墨烯的就更多了，诸如VMD的extensions - modeling - nanotube builder

azero · 发表于 Post on 2020-7-1 08:50:19

sobereva 发表于 2020-6-29 19:04
氧化石墨烯有现成的工具
https://github.com/Ngtungfei/Graphene-Oxide-Generator
https://github.com/ar ...

谢谢SOB老师~

行行真的行 · 发表于 Post on 2021-12-28 20:20:05

同学你学会怎么建sam界面了吗，想学习一下

行行真的行 · 发表于 Post on 2022-5-5 21:11:09

行行真的行发表于 2021-12-28 20:20
同学你学会怎么建sam界面了吗，想学习一下

同学请问你学会了吗，能交流一下吗

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[建模与可视化] 请教如何构建吸附材料SAM，石墨烯等吸附材料的模型