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[GROMACS] 请教如何使用粗粒化的mW水模型?

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模拟中描述水的模型有很多,但大都是全原子模型。2009年Molinero等人借鉴了 Stillinger-Weber (SW) silicon  potential,提出了水的粗粒化模型,mW水模型,从而在计算速度上提高了两个数量级。该模型将一个水分子视为一个粒子,用正四面体的配位倾向来促进水分子形成类似“氢键网络结构”的分布特征。虽然在lammps中能比较轻易修改相互作用参数,但在gromacs中,却没有SW这样的非键相互作用类型。请问如何在计算速度更快的gromacs上实现对mW水模型的使用?

Molinero V, Moore E B. Water modeled as an intermediate element between carbon and silicon[J]. The Journal of Physical Chemistry B, 2009, 113(13): 4008-4016.


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发表于 Post on 2022-5-19 13:21:38 | 只看该作者 Only view this author
您好,这个问题解决了吗

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