什么是“Reference Level”和“Vacuum Level”？

astrozheng

是这样的，本人原本是分子动力学方向的PhD, 然而最近需要帮别人计算分子（多聚物）的能量（Single Point Energy）。 然而我是量化计算的小白一个。

首先我用ORCA软件计算出了那个分子在Water solvent中的HOMO和LUMO能量。这个分子可以是很多个单体的聚合物，我分别算了dimer， trimer 和hexmer的HOMO和LUMO，这也是别人需要得到的数据。
我是这么说的：
“

I tried to explore the dynamics (at 300K) of the dimer, trimer and hexmer. And I picked out the most populated representative conformations of the three types of this polymers for quantum calculation of their LUMO and HOMO energies, based on the DFT method (B3LYP-gCP-D3/6-31G* in water solvent environment).

The results are listed here:

”

但是被别人问及“Reference Level”和“Vacuum Level”分别是多少。然后我就蒙了，显然我还没有入门量化计算。别人是这么回复的：
“

Thank you for your help. May I check with you what is the reference level and what is the level of vacuum?

I need these information to align these levels.

”
请问此话何解？

谢谢各位大神，不甚感激！

sobereva

不如说那个人没有入门量化计算，量化里极少有用这两个词的。
只要你把多聚体，以及单体在孤立状态下的能量都算出来就够了。相互作用能是用多聚体减去相应数目的单体的能量差，因此孤立状态下单体能量和可以算是用来计算相互作用能的参考态。

astrozheng

非常感谢Sob！

这样啊，看来我是还需要提供单体的孤立状态的能量是么？不过已经有点糊涂了。确实用reference level和quantum 一起google，没有找到啥有用的信息。

但这里又和“Vacuum”有什么关系呢？因为考虑到实际情况就是在水中做了分子动力学的模拟，计算能量的时候应该是需要考虑solvent的吧。

sobereva

astrozheng 发表于 2016-4-4 23:14
非常感谢Sob！

这样啊，看来我是还需要提供单体的孤立状态的能量是么？不过已经有点糊涂了。确实用refer ...

是需要提供单体孤立状态的能量。否则光有个多聚体的绝对能量并没有什么化学意义。
Vacuum level这种说法更不确切了。或许是想让你同时计算出真空下的能量，这样和溶剂下的能量求差得到的是溶解自由能。

astrozheng

sobereva 发表于 2016-4-5 00:36
是需要提供单体孤立状态的能量。否则光有个多聚体的绝对能量并没有什么化学意义。
Vacuum level这种说法 ...

嗯嗯，谢谢sob！
就是需要个参照，这个算起来应该快。
灰常感谢！