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[新手求助] 请教高斯计算偶极矩结构优化文件和频率计算文件结果不一致问题

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本帖最后由 DUNING 于 2018-11-29 15:53 编辑

在激发态优化过程中由于软件问题不能opt+freq一起算,只能分开算。先算opt,后计算freq,但在两个结果log文件中偶极矩大小不一致,opt产生的log文件中偶极矩要比freq的log文件大很多,请问是怎么回事?哪个结果才是激发态的偶极矩?
freq.log



opt.log


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发表于 Post on 2018-11-29 16:43:32 | 只看该作者 Only view this author
用优化完的结构,算单个结构的TDDFT,写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density,最后给出的偶极矩就是第x激发态的偶极矩
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-29 16:57:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-29 16:43
用优化完的结构,算单个结构的TDDFT,写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density,最后给出的偶极矩就是第x ...

好的,谢谢sob老师,请问如果是在溶剂当中的话,也是同样的方法吗?

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发表于 Post on 2018-11-29 23:08:39 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-11-29 16:57
好的,谢谢sob老师,请问如果是在溶剂当中的话,也是同样的方法吗?

是。但这是以最简单的方式考虑溶剂对溶质跃迁的响应的做法,还有更复杂、更耗时的特定态模型。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-11-30 09:55:50 | 只看该作者 Only view this author
贴出输入文件才能讨论。   优化和频率计算   最重要的是频率用的是opt最后一步构型且保持关键词一致(除opt和freq外)   这样结果才有意义

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发表于 Post on 2022-7-15 09:58:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-29 16:43
用优化完的结构,算单个结构的TDDFT,写诸如TD(root=x) PBE1PBE/6-31G* density,最后给出的偶极矩就是第x ...

老师您好,1.如果我算普通全主族前三周期元素 小分子的基态偶极矩,能否用B3LYP/6-31G(d)优化完之后,再用PBE0/def2TZVP来算偶极矩?2.如果还想算logP,您推荐什么类型的单点能计算使用基组来算 水、辛烷溶剂模型下吉布斯自由能差? 望您解惑

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发表于 Post on 2022-7-15 15:07:36 | 只看该作者 Only view this author
Changwenxu 发表于 2022-7-15 02:58
老师您好,1.如果我算普通全主族前三周期元素 小分子的基态偶极矩,能否用B3LYP/6-31G(d)优化完之后,再 ...

1. 可以,但假如分子特别小(比如20个原子以内),建议用大基组做优化,反正也跑得动;假如分子不是特别小,结构优化时必须加色散校正。
2. 按http://sobereva.com/327计算
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-7-15 18:46:08 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-15 15:07
1. 可以,但假如分子特别小(比如20个原子以内),建议用大基组做优化,反正也跑得动;假如分子不是特别 ...

感谢!

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发表于 Post on 2022-7-16 09:00:59 | 只看该作者 Only view this author
Changwenxu 发表于 2022-7-15 09:58
老师您好,1.如果我算普通全主族前三周期元素 小分子的基态偶极矩,能否用B3LYP/6-31G(d)优化完之后,再 ...

对偶极矩精度要求高,而且算得动的话,建议用def2-TZVPD
结合SMD的话,用M05-2X/6-31G*,《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》(http://sobereva.com/327)里说了
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发表于 Post on 2022-7-16 15:39:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-16 09:00
对偶极矩精度要求高,而且算得动的话,建议用def2-TZVPD
结合SMD的话,用M05-2X/6-31G*,《谈谈隐式溶剂 ...

收到!感谢S大

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发表于 Post on 2022-7-16 18:34:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-16 09:00
对偶极矩精度要求高,而且算得动的话,建议用def2-TZVPD
结合SMD的话,用M05-2X/6-31G*,《谈谈隐式溶剂 ...

one more question, 算logp想引用您的chemrixv 那篇算C18环的预印,不知道格式是什么?

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Changwenxu 发表于 2022-7-16 18:34
one more question, 算logp想引用您的chemrixv 那篇算C18环的预印,不知道格式是什么?

Tian Lu, Qinxue Chen, Zeyu Liu, A Thorough Theoretical Exploration of Intriguing Characteristics of Cyclo[18]carbon: Geometry, Bonding Nature, Aromaticity, Weak Interaction, Reactivity, Excited States, Vibrations, Molecular Dynamics and Various Molecular Properties, ChemRxiv (2019) DOI: 10.26434/chemrxiv.11320130
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发表于 Post on 2022-7-18 14:37:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-17 10:04
Tian Lu, Qinxue Chen, Zeyu Liu, A Thorough Theoretical Exploration of Intriguing Characteristics o ...

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