求助：ovito分析多次级联碰撞产生的缺陷异常增多的问题

墨茶茶

各位老师好！我最近在用lammps做多次级联碰撞的研究。我用lammps建立了一个模型，首先使用displace_atoms将盒子中所有的原子向任意方向平移一个矢量，之后在模型中随机选择一个中间位置的原子作为PKA原子进行级联碰撞模拟(每次级联碰撞选择的原子种类和赋予的能量都相同)，级联碰撞结束后将盒子中的原子整体反向平移相同的矢量，输出模型，之后再重复上述步骤进行下一次级联碰撞。之后我将每次级联碰撞结束后的模型放入ovtio中用ovito自带的Wigner-Seitz defect analysis功能进行点缺陷分析。分析发现，点缺陷的数量会在某些时刻发生极其异常的暴增，之后又会很快的回到暴增前的水平。比如第n次级联后模型中残余的缺陷为10^2个左右，但到第n+1次级联碰撞后模型中的点缺陷又会暴增10^5个左右(就像凭空出现一般)，并且到第n+3次左右又会回到10^2个左右，之后会反复出现这种情况。我翻遍国内外论坛，有人认为是ovito自带的软件识别错误，有人认为是模型发生了漂移(我只在级联碰撞前后使用了displace_atoms命令)，但没有人提出解决方案。因此我想请问一下各位老师有没有碰到和我相同的情况，请问是如何解决的。

第n次级联碰撞时的缺陷数量

第n+1次时级联碰撞缺陷数量

第n+2次时级联碰撞缺陷数量

小石

您好，我也是做辐照相关的，最近遇到类似的问题，可以交流下吗？

小石

小石 发表于 2024-5-18 10:26
您好，我也是做辐照相关的，最近遇到类似的问题，可以交流下吗？

联系方式qq:2622442820

墨茶茶

小石 发表于 2024-5-18 10:26
您好，我也是做辐照相关的，最近遇到类似的问题，可以交流下吗？

你好，原因是在级联模拟过程中盒子中的原子整体发生了平移，因此在级联过程中要加一个fix   4 all recenter INIT INIT INIT，以固定盒子内的原子不要发生除碰撞外的平移。

Haozhou

墨茶茶 发表于 2024-10-7 16:59
你好，原因是在级联模拟过程中盒子中的原子整体发生了平移，因此在级联过程中要加一个fix   4 all recent ...

你好老师，我用了您的这个命令后还是会出现这种异常现象，是什么原因呢，我CNA和位错线分析都是没问题的，但就是在看frankelpair这里出了问题

墨茶茶

Haozhou 发表于 2024-12-30 23:17
你好老师，我用了您的这个命令后还是会出现这种异常现象，是什么原因呢，我CNA和位错线分析都是没问题的 ...

我也不太清楚了，你可以附上几个图看看