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[综合交流] 激发态相对与基态无量纲位移中能量梯度怎么计算的?

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independent mode-displaced harmonic oscillator (IMDHO) model 中计算激发态相对与基态无量纲位移,涉及到激发态的能量梯度,这个梯度是怎么计算的呢?

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发表于 Post on 2022-6-16 10:24:25 | 只看该作者 Only view this author
诸如Gaussian在TDDFT级别下计算,用常规TDDFT计算的关键词加上force关键词即可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-16 20:01:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-16 10:24
诸如Gaussian在TDDFT级别下计算,用常规TDDFT计算的关键词加上force关键词即可


谢谢老师的指教。无量纲位移计算中涉及的激发态能量梯度应该是激发态能量梯度在基态平衡位置的值吧(如黄色标记)。常规TDDFT计算的关键词加上force关键词计算的应该就是特定激发态能量梯度。两者应该不同吧。请老师指导,感谢!




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发表于 Post on 2022-6-17 20:15:04 | 只看该作者 Only view this author
doublehs 发表于 2022-6-16 20:01
谢谢老师的指教。无量纲位移计算中涉及的激发态能量梯度应该是激发态能量梯度在基态平衡位置的值吧(如 ...

贴图方式不对,第一张图看不到

任意坐标下都可以计算特定激发态的受力(能量梯度的负矢量)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-18 09:54:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-17 20:15
贴图方式不对,第一张图看不到

任意坐标下都可以计算特定激发态的受力(能量梯度的负矢量)

嗯,好像明白了。刚看到老师写的帖子“在VMD中显示Gaussian计算的原子受力”,帖子中“例1:联苯的基态极小点结构下在S1势能面上的原子受力”应该就是在基态结构下算S1的能量梯度吧。

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发表于 Post on 2022-6-18 15:07:30 | 只看该作者 Only view this author
doublehs 发表于 2022-6-18 09:54
嗯,好像明白了。刚看到老师写的帖子“在VMD中显示Gaussian计算的原子受力”,帖子中“例1:联苯的基态极 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-21 17:23:08 | 只看该作者 Only view this author

谢谢老师。请问老师,图片1是计算无量纲位移的例子吗,为什么计算结果总是出现错误呢?

360截图20220621171755689.jpg (155.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

ORCA manual example

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发表于 Post on 2022-6-21 21:36:28 | 只看该作者 Only view this author
doublehs 发表于 2022-6-21 10:23
谢谢老师。请问老师,图片1是计算无量纲位移的例子吗,为什么计算结果总是出现错误呢?

你用的是什么版本的orca?如果不是最新版,更新到最新版(5.0.3)再试
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-21 22:15:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-21 21:36
你用的是什么版本的orca?如果不是最新版,更新到最新版(5.0.3)再试

是5.0.0,是版本的原因吗?

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发表于 Post on 2022-6-21 22:18:50 | 只看该作者 Only view this author
doublehs 发表于 2022-6-21 15:15
是5.0.0,是版本的原因吗?

对,比较早的版本可能有一些bug,具体见https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewforum.php?f=15
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-21 22:24:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-21 22:18
对,比较早的版本可能有一些bug,具体见https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewforum.php?f=15

谢谢。5.0.2怎么样?网上没找到5.0.3版本,现在论坛也登不上去吧。

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发表于 Post on 2022-6-21 22:39:15 | 只看该作者 Only view this author
doublehs 发表于 2022-6-21 15:24
谢谢。5.0.2怎么样?网上没找到5.0.3版本,现在论坛也登不上去吧。

可以试试,不保证行
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-21 22:47:54 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-21 22:39
可以试试,不保证行

好的,非常感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-25 18:15:31 | 只看该作者 Only view this author
doublehs 发表于 2022-6-21 22:47
好的,非常感谢!



  [size=13.2835px]orca的版本是5.0.3的,按照orca5.0.3的例子(见图片)计算,为什么生成不了用于下一步计算的[size=9.9626pt]Test-ASA-H2CO.asa.inp文件呢?

360截图20220625180800653.jpg (150.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-29 22:55:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-17 20:15
贴图方式不对,第一张图看不到

任意坐标下都可以计算特定激发态的受力(能量梯度的负矢量)

老师,为什么我用orca手册的例子计算,结果总是出现以下结果呢?orca5.0.0换成5.0.3还是不行。感谢感谢!*** ORCA-CIS/TD-DFT FINISHED WITHOUT ERROR ***Maximum memory used throughout the entire CIS-calculation: 43.1 MB
Segmentation fault (core dumped)


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