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[GROMACS] Gromacs如何限制两个相同组分的磷脂双分子层的其中一层

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楼主
各位老师们好,我最近用gromacs建了一个双层膜体系,也就是有两层同样组成成分的磷脂双分子层,现在要对处于下层的磷脂双分子层进行位置限制,参考别人的itp文件编写时,发现是对原子类型进行限制,但是我的体系的两层膜的组成成分相同,一限制就会将上下两层膜都限制,请问如何做到只限制下面的膜呢?

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发表于 Post on 2021-11-8 22:13:53 | 只看该作者 Only view this author
把上下两层的磷脂定义成不同的[moleculetype]作为不同种类分子,给下层的那类里添加[ position_restraint ]实现位置限制
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-9 12:49:39 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,已成功

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