如何较好关联分子动力学模拟后的dRMSF和RMSD数据，以更好的解释实验结果

zhencheng874125

请问，
1. 如何绘制每个变体的RMSF数据的DCCM（在Bio3D中），以确定RMSF标记的残基是否涉及影响稳定性和/或活性位点的任何关键网络。
2. 是否有某种方法可以较好的将MD后的dRMSF和RMSD关联，如标黑我们综合实验结果发现的问题（dRMSF对于酶蛋白热稳定性而言仅有几个氨基酸相关性较好；RMSD则对于酶活性相关性较好）怎样可以将二者综合起来？


具体问题如下：
1. Map DCCM (in Bio3D) for RMSF data of each variant, to establish whether the flagged residues above for RMSF are involved in any key networks that affect stability and/or the active site.
2. Is there a way to combine the analysis of RMSF and RMSD, eg. In a ML or other approach?  RMSD and activity correlate reasonably well, whereas RMSF and stability correlate well at certain residues.  A combined RMSD and RMSF correlation may work better?

zhencheng874125

怎么没人回答呢，可以悬赏吗？