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[GROMACS] 求助gmx sham得到的熵、焓xpm文件的物理意义

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本帖最后由 bingzan 于 2022-8-28 10:32 编辑

      各位老师好,用gmx sham命令可以得到gibbs.xpm,enthalpy.xpm,entropy.xpm。   请问这三张形貌图里的颜色分别代表吉布斯自由能绝对值(KJ/mol),焓绝对值(KJ/mol),熵*温度绝对值(KJ/mol)对吗?还是deltaG,deltaS, deltaH?我看了gmx sham命令的介绍,没有详细说明。
    这三个xpm转化成txt后可以得到数据,根据G=H-TS,我发现后二者之差并不等于吉布斯自由能,所以我不明白gmx sham命令得到的xpm文件的物理意义。


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发表于 Post on 2022-9-5 06:42:11 | 只看该作者 Only view this author
请问lz搞明白了吗

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