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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助，mol2文件格式问题
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[综合交流] 求助，mol2文件格式问题

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那年冬天风在吹

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发表于 Post on 2022-8-26 10:30:36 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
本帖最后由 那年冬天风在吹 于 2022-8-26 10:42 编辑

如图箭头所示，mol2文件格式说明中原子行表示包含原子的子结构名称，这个子结构是指什么？比如如果该mol2文件记录的是一个ligand，这个子结构是指什么？
如图，官网示例，对于一个苯来说，这个子结构貌似就是一个苯
如图，本人这里有从pdbbind里下载得到的配体mol2文件，这一列似乎表示受体的氨基酸，但配体应该不属于氨基酸，不知道这里是否是表示的错误



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