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[Gaussian/gview] gaussian09计算终止报错” Symmetry not used in FoFCou“

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本帖最后由 ynzhou 于 2024-10-5 16:28 编辑

从先前的计算结果中读取波函数的初始猜测,用的是个人编译版的g09来计算,提交任务后马上终止了计算,不知是什么原因?
输入文件如下,生成的log.文件在附件里。

%chk=./7_ALA_I.chk
%mem=10GB
%nprocshared=8
#p revm06/gen int=grid=ultrafine guess=read scf=maxcycle=1

18

1 1
N      16.42500000     -1.00500000    -12.19500000
C      17.09100000     -1.79600000    -11.16800000
C      17.45200000     -0.93400000     -9.96500000
O      17.85700000      0.22300000    -10.11500000
C      18.33400000     -2.45900000    -11.72900000
H      15.60100000     -0.57100000    -11.80500000
H      17.05400000     -0.29000000    -12.53100000
H      16.15800000     -1.60500000    -12.96200000
H      16.40500000     -2.57600000    -10.83800000
H      18.81800000     -3.04500000    -10.94800000
H      18.05600000     -3.11400000    -12.55400000
H      19.02300000     -1.69500000    -12.08900000
N      17.30200000     -1.50800000     -8.77100000
C      17.74100000     -0.85500000     -7.55100000
H      16.87400000     -2.42000000     -8.69900000
H      17.52400000     -1.49600000     -6.69700000
H      18.81400000     -0.67100000     -7.60300000
H      17.21500000      0.09300000     -7.43600000

@/home/ynzhou/DFT/ma-TZVP.txt/N

终端报错:[color=rgba(0, 0, 0, 0.82)]PGFIO-F-217/list-directed read/unit=9898/attempt to read past end of file.
[color=rgba(0, 0, 0, 0.82)] File name = wx.txt    formatted, sequential access   record = 13

[color=rgba(0, 0, 0, 0.82)] In source file revtHCTHx.f, at line number 268

[color=rgba(0, 0, 0, 0.82)]  --- traceback not available


生成的log.文件最后一部分如下:
The electronic state of the initial guess is 1-A.
Leave Link  401 at Sat Oct  5 16:12:48 2024, MaxMem= 1342177280 cpu:       2.9
(Enter /home/ynzhou/soft/g09-fitrevM06/l502.exe)
Closed shell SCF:
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within   1 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on             energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral symmetry usage will be decided dynamically.
       425965 words used for storage of precomputed grid.
IEnd=      791506 IEndB=      791506 NGot=  1342177280 MDV=  1341505836
LenX=  1341505836 LenY=  1341385774
Fock matrices will be formed incrementally for   1 cycles.

Cycle   1  Pass 1  IDiag  1:
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=           0
         NFxFlg=           0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T
         Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl=     500 IOpCl=  0
         NMat0=    1 NMatS0=    1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
         I1Cent=           0 NGrid=           0.
Symmetry not used in FoFCou.






7_ALA_I.log

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发表于 Post on 2024-10-5 16:34:22 | 只看该作者 Only view this author
Symmetry not used in FoFCou. 不是报错。

真正的报错是你的终端报错。

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发表于 Post on 2024-10-6 01:41:46 | 只看该作者 Only view this author
你自己编译的修改版程序有问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-6 10:34:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-6 01:41
你自己编译的修改版程序有问题

老师,我试过用其他泛函比如m062x可以运行成功,还可能是程序的问题吗?

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发表于 Post on 2024-10-7 02:45:25 | 只看该作者 Only view this author
ynzhou 发表于 2024-10-6 10:34
老师,我试过用其他泛函比如m062x可以运行成功,还可能是程序的问题吗?

revm06不是内置方法,肯定是牵扯到自己额外扩展的代码,这问题应该问提供你修改版代码的人,他自然有跑成功的经验

非要用这个泛函的话,Gaussian又运行不成功,也可以用ORCA,其自带的libXC库里有这个泛函。ORCA靠libXC能用的泛函用orca -libxcfunctionals命令可以罗列。使用的写法参考北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KAQC_content.html)的ppt:

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-7 22:36:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-7 02:45
revm06不是内置方法,肯定是牵扯到自己额外扩展的代码,这问题应该问提供你修改版代码的人,他自然有跑成 ...

谢谢老师指点!确实是程序的问题,已解决了

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