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[VASP] dimer做过渡态时遇到的问题,怎么确定算出来的结构可以连接初态和末态?

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楼主
老师们好,我在算过渡态时使用了dimer,但是往届师兄在用dimer算过渡态时,盲审专家问了一个问题:你怎么确定你算出来的结构是可以连接你的初态和末态的?当时师兄也懵了。我刚接触过渡态的计算,也不懂这个问题,但是确实,dimer只用了一个过渡态的初猜结构来计算的,不像CI-neb根据IS和FS进行插点,直接连接了初末态。请各位老师解答一下。

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发表于 Post on 2024-9-2 08:52:28 | 只看该作者 Only view this author
跑NEB进行验证
或者按照虚频模式微调结构,然后用小步长上限进行优化,确认得到的结构对应期望的极小点
不限于VASP,对于CP2K等其它程序也是同理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-2 09:33:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-2 08:52
跑NEB进行验证
或者按照虚频模式微调结构,然后用小步长上限进行优化,确认得到的结构对应期望的极小点
...

谢谢sob老师,第一种方法我明白,就是在初末态之间插一个点然后将该过渡态的CONTACR复制进去,但是您说的第二种方法我不太明白,是不是做一步IRC呢

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发表于 Post on 2024-9-3 11:25:50 | 只看该作者 Only view this author
AlexGerry 发表于 2024-9-2 09:33
谢谢sob老师,第一种方法我明白,就是在初末态之间插一个点然后将该过渡态的CONTACR复制进去,但是您说的 ...

不是。我说的是常规的几何优化
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