计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 710|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] cp2k同样的inp,同样的电脑,四次计算,四个结果,请问如何解决

[复制链接 Copy URL]

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位大佬,最近使用cp2k进行几何优化计算,对相同inp文件进行重复计算,计算四次,得到四个不同能量值,请问这是为什么呀?


按道理说,同一个inp文件,计算出来的结果不应该是一致的嘛
观察了四次计算后的几何结构,发现结构基本上都是一样的,但就是总能量有所差别,最大差距达到0.05a.u.或者是0.05Ha?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112543

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-7-26 22:54:56 | 只看该作者 Only view this author
拿具体文件、结果数值说事

并且仔细看此文
数值误差对计算化学结果重现性的影响
http://sobereva.com/88
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-27 16:24:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 THY 于 2024-7-27 16:35 编辑
sobereva 发表于 2024-7-26 22:54
拿具体文件、结果数值说事

并且仔细看此文

老师,四个结果的总能量分别是 -1705.4010687967,  -1705.3988140113, -1705.4321720186, -1705.4426476877



老师,附上了inp文件和四个out文件,麻烦您看一下

文件.zip

334.93 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-27 16:36:11 | 只看该作者 Only view this author
THY 发表于 2024-7-27 16:24
老师,四个结果的总能量分别是 -1705.4010687967,  -1705.3988140113, -1705.4321720186, -1705.44264 ...

另外老师, -1705.4010687967,  -1705.3988140113, -1705.4321720186, -1705.4426476877这些数值的单位是a.u.吗?怎么转成eV



5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112543

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2024-7-29 02:50:44 | 只看该作者 Only view this author
THY 发表于 2024-7-27 16:36
另外老师, -1705.4010687967,  -1705.3988140113, -1705.4321720186, -1705.4426476877这些数值的单 ...


google搜Hartree eV
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112543

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-7-29 02:57:54 | 只看该作者 Only view this author
THY 发表于 2024-7-27 16:24
老师,四个结果的总能量分别是 -1705.4010687967,  -1705.3988140113, -1705.4321720186, -1705.44264 ...

这就属于前面提到的博文提到的微小的随机性在计算过程中被放大的情况
如果把SCF收敛限和几何优化收敛限设得更严,可能能让每次运行结果的差异变得更小。如果非要从已经跑的结果里取一个能量的话,原理上应当取能量最低那个。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

185

帖子

1

威望

4139

eV
积分
4344

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2024-7-29 09:17:20 | 只看该作者 Only view this author
每个 out 里都有至少一次 SCF run NOT converged

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-29 10:03:14 | 只看该作者 Only view this author
highlight 发表于 2024-7-29 09:17
每个 out 里都有至少一次 SCF run NOT converged

是的,这个影响大吗?有时候是没有not converged

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-29 10:05:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-29 02:57
这就属于前面提到的博文提到的微小的随机性在计算过程中被放大的情况
如果把SCF收敛限和几何优化收敛限 ...

明白了,谢谢老师

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-31 15:47:13 | 只看该作者 Only view this author
highlight 发表于 2024-7-29 09:17
每个 out 里都有至少一次 SCF run NOT converged

请问老师,这个有影响嘛?

23

帖子

0

威望

135

eV
积分
158

Level 3 能力者

11#
发表于 Post on 2024-9-3 15:45:36 | 只看该作者 Only view this author
THY 发表于 2024-7-31 15:47
请问老师,这个有影响嘛?

你提供的文件inp和out不对应吧,out里面不收敛还能继续计算,但是inp里面“IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE”是被注释掉的。
关于“IGNORE_CONVERGENCE_FAILURE”,看http://sobereva.com/61“附:对Gaussian中IOp(5/13=1)的大批判”,这两个是一个意思。
所以你的四个数据不统一不是因为平台不一样也不是因为计算有误差

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 17:54 , Processed in 0.272034 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list