求助，VMD根据二面角的数值对单体进行颜色标注

842655799 · 发表于 Post on 2022-11-1 21:34:11

各位老师，我想对纤维素中的葡萄糖单体进行颜色标注。假设一条纤维素链有10个葡萄糖单体，通过一个羟甲基的二面角（O1-C2-C3-O4）的数值进行单体颜色的标注，每个单体中原子的原子类型是一致的（二面角也是一样），用VMD能不能实现，求指点。可以假设二面角-180~-60度为绿色，-60~60度为黄色，60~180度为紫色。

lyj714 · 发表于 Post on 2022-11-2 01:21:06

显然可以，通过写tcl脚本判断二面角大小并创建不同颜色的represent即可达到需要的效果。

842655799 · 发表于 Post on 2022-11-2 09:48:07

lyj714 发表于 2022-11-2 01:21
显然可以，通过写tcl脚本判断二面角大小并创建不同颜色的represent即可达到需要的效果。

大佬大佬，可否教一下，我现在只会输出这个二面角的角度，怎么实现通过二面角标记颜色，能不能详细一些，感谢

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[VMD] 求助，VMD根据二面角的数值对单体进行颜色标注

浏览过的版块