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[GROMACS] 为什么我用gaussview生成的mol2文件不能在GGenFF里面生成str文件

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wanghao12000

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发表于 Post on 2022-11-8 10:57:46 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
请问各位老师，我想用NAMD来模拟一个两性离子，但是我没有他的力场文件，所以我要用这个GGenFFUpload Molecule (umaryland.edu)网站来生成。我跟着几种生成有机分子GROMACS拓扑文件的工具 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)这个教程走了一遍，没想到第一步就走不通。请问各位老师这是什么原因呢？

这里是我的mol2文件

smba.mol2

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