计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 61|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 使用sobEDA做能量分解分析报错

[复制链接 Copy URL]

7

帖子

0

威望

83

eV
积分
90

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
老师您好,Gaussian16使用的是A03版本,Multiwfn_3.8_dev_bin_Linux_noGUI用的是2024年10月24日版本,算的体系比较大,算第一个体系计算成功了,算第二个大小差不多的体系时输出下面的内容Note: Calculation of whole system will be conducted in unrestricted way

Generating fch file of promolecular state via Multiwfn (promol.fch)
Running: unfchk promol.fch promol.chk
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx 000000000231fdd8, rcx ffffffffffffffff
   rdx 0000000000002352, rsp 00007ffe1d13e938, rbp 00007ffe1d13e990
   rsi 000000000000000b, rdi 0000000000002352, r8  00002af3c8db1ac0
   r9  00002af3c8db1ac0, r10 00007ffe1d13dd20, r11 0000000000000202
   r12 00007ffe1d13ec20, r13 000000000231ffc1, r14 0000000000000003
   r15 00007ffe1d140168
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf5d0) [0x2af3c8fa15d0]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2af3c94e64d7]
  unfchk() [0x485819]
  unfchk() [0x46aad0]
  unfchk() [0x479d12]
  unfchk() [0x47b626]
  unfchk() [0x4504d1]
  unfchk() [0x44f4aa]
  unfchk() [0x44f3f4]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2af3c94d23d5]
  unfchk() [0x44f2e9]
./sobEDA.sh: line 159:  9042 Aborted                 (core dumped) unfchk promol.fch promol.chk > /dev/null
Generating Gaussian input file of promolecular state via Multiwfn (promol.gjf)
Running: g16 < promol.gjf &> promol.out
Error encountered, please check corresponding output file! Now script exits
修改export GAUSS_MEMDEF为20GB也不管用
附件为输入文件,谢谢您。

fragment.txt

24 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

sobEDA.sh

14.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

system.xyz

12.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

template.gjf

242 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-11-9 09:12:16 | 只看该作者 Only view this author
检查promol.fch产生成功了没有。例如Multiwfn载入后用主功能0看轨道。文件正常的话,手动用unfchk转一次看看情况
并且尝试Au团簇的片段当单重态闭壳层看是否能成功
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 06:07 , Processed in 0.178225 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list