计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1218|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[并行运算] 双路CPU仿真使用状况疑问

[复制链接 Copy URL]

10

帖子

0

威望

173

eV
积分
183

Level 3 能力者

本帖最后由 3969832 于 2022-11-7 14:11 编辑

我用COMSOL进行计算,计算设置是batch sweep,原理上是开很多个单独的进程跑完全独立的仿真文件,多个进程之间是基本完全独立的。 原则上应该能够完全发挥两路CPU的能力,实际上也是的,win11任务管理器显示的CPU占用率是50%满了(因为COMSOL没法用超线程,最多占用50%)。

但是奇怪的地方是,观察两路CPU的温度情况时会发现其中一路cpu温度很低35度,近似空载,而另一路CPU貌似满载有60度,如下图1。从CPU温度来看,并没有2路CPU满载。同时从任务管理器的CPU使用情况中也看到,全程都是节点0在工作,节点1都是空载。

请问这是什么原因啊?

2022.11.7更新:原因找到了 坑爹的超线程对COMSOL是副作用 导致一个CPU完全空载 把超线程关掉就没问题了 关掉超线程的情况下相比没关 速度快了40%以上

截屏2022-11-02 17.53.55.png (603.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 60)

截屏2022-11-02 17.53.55.png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-11-3 09:10:02 | 只看该作者 Only view this author
COMSOL我不清楚,可以自行设置进程和CPU核心的绑定,反复尝试弄清楚是什么情况

下文可部分参考
通过设置CPU内核绑定降低ORCA同时做多任务的耗时
http://sobereva.com/553http://bbs.keinsci.com/thread-17751-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

10

帖子

0

威望

173

eV
积分
183

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-3 10:42:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-3 09:10
COMSOL我不清楚,可以自行设置进程和CPU核心的绑定,反复尝试弄清楚是什么情况

下文可部分参考

好的谢谢

10

帖子

0

威望

173

eV
积分
183

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-7 13:54:50 | 只看该作者 Only view this author
原因找到了 坑爹的超线程对COMSOL是副作用导致一个CPU完全空载 把超线程关掉就没问题了

2301

帖子

1

威望

5473

eV
积分
7794

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2022-11-7 14:56:07 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈,又是一个超线程受害者……

我从来都是建议,直接关闭超线程,
然后再配置一个work load manager 。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 15:27 , Processed in 0.207783 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list