几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集

sobereva · 发表于 Post on 2014-10-26 18:40:02

这是几何优化、过渡态搜索、IRC的理论和算法相关的45篇综述与56篇原文合集

几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集(2014-Oct-6).part5.rar (6.54 MB, 下载次数 Times of downloads: 2348)

几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集(2014-Oct-6).part4.rar (9.5 MB, 下载次数 Times of downloads: 2030)

几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集(2014-Oct-6).part3.rar (9.5 MB, 下载次数 Times of downloads: 1999)

几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集(2014-Oct-6).part2.rar (9.5 MB, 下载次数 Times of downloads: 2005)

几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集(2014-Oct-6).part1.rar (9.5 MB, 下载次数 Times of downloads: 2580)

几何优化算法、过渡态搜索算法和IRC生成算法在很多文章里是一起讨论的。很多方法如RFO、GDIIS既能用于做几何优化也能搜索过渡态（因为它们都是势能面的驻点）。有点方法只适用或常用于某类计算（量子化学、第一性原理、分子力学），应根据自己的实际情况进行判断。

对于量子化学的初学者，建议先看“综述”文件夹里面的（按照推荐顺序）
Geometry optimization.pdf
Chem6440 Geom.ppt
Chapter 12-Introduction to Computational Chemistry(2ed,Jensen).pdf
Geometry Optimization I(Encyclopedia of Computational Chemistry).pdf
Chapter 5-Molecular modelling Principles and applications(Leach A.R.,2ed).pdf
一些文档里面有一些批注，里面的说法可能有误，无视即可。

另外，过渡态搜索方法最全面的介绍可参见《过渡态、反应路径的计算方法及相关问题》（http://sobereva.com/44）。其中很多讨论完全适用于几何优化。

PS：几何优化不收敛是新人最最最常问的问题之一。我相信，当读者看完了上面推荐的综述，再看了笔者专门写过的帖子《量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法》（http://sobereva.com/164），就不会再因为这个问题犯难了。

378024572 · 发表于 Post on 2014-11-11 19:39:29

好帖。。。。。。。。。。。

aqhuangry · 发表于 Post on 2014-11-12 12:39:08

顶顶

ahehyh · 发表于 Post on 2014-11-14 23:03:32

楼主可否搜集整理下关于各密度泛函的相关原文献呢，感觉国内这方面的资料比较少。

sobereva · 发表于 Post on 2014-11-15 01:11:15

ahehyh 发表于 2014-11-14 23:03
楼主可否搜集整理下关于各密度泛函的相关原文献呢，感觉国内这方面的资料比较少。

泛函实在太多了，而且太杂，虽然平时时不时也收了50多篇，但还远远不够全，就不发了

ximi1986 · 发表于 Post on 2014-12-27 11:10:24

好帖子，顶一个~

jyki · 发表于 Post on 2015-1-8 12:54:51

谢谢整理并分享自己的劳动成果:lol

therotyonth · 发表于 Post on 2015-1-15 17:18:36

谢谢整理!

我爱吃鱼 · 发表于 Post on 2015-11-24 18:03:59

谢谢哦，正在研究这块~~~

renleibeth · 发表于 Post on 2016-3-20 21:45:51

sobereva老师，为什么我下载不了呢？用迅雷下载的时候，一直显示任务失败。

sobereva · 发表于 Post on 2016-3-20 22:15:21

renleibeth 发表于 2016-3-20 21:45
sobereva老师，为什么我下载不了呢？用迅雷下载的时候，一直显示任务失败。

直接下载，或者用百度云管家，不要用第三方下载工具

xxy88888 · 发表于 Post on 2016-6-18 16:17:10

感谢感谢，辛苦！

暮光边缘 · 发表于 Post on 2016-9-14 10:46:57

谢谢分享

sobereva · 发表于 Post on 2016-9-15 11:55:00

itccnjuer 发表于 2016-9-15 11:46
百度网盘，帐号和密码是多少

没设密码

sobereva · 发表于 Post on 2016-9-15 15:43:55

itccnjuer 发表于 2016-9-15 14:58
不能下载，要开通会员，才能下载

注册个百度账号就完了
注册是免费的

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[算法与编程] 几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集

评分 Rate