平面金属doping类石墨烯材料的建模问题

xiongb123456 · 发表于 Post on 2016-6-3 09:32:40

现在实验室做一些有关水氧化反应方面的实验，希望能够通过理论计算给予验证。在文献调研中我发现大部分的文章都是使用了MS和VASP这两个软件，考虑到自身版权问题，我们选择了MS这个软件（购买了CASTEP和DMOL3模块）。我是初学者，只能看着别人的文献，类比去考虑自己的体系。
1. 如图1所示，文献作者使用dmol3对Fe-N-C体系进行计算（而我们做的是一个Co-N-C体系与此文类似），但是据我所知dmol3的计算需要输入晶胞参数，那么对于文献中的这个体系，如果我希望直接构建出文献中的模型，然后用Co原子去取代Fe原子的话，那么怎么能够确定他的晶胞参数a，b和c呐，还有艾尔法贝塔等角度呐？如果可能，希望能提供一些详尽点儿的建模过程或是教程。

PS：如果是单纯的石墨烯中一个原子被金属Co原子取代，可以如图2这种情况，这个我可以构建出来，网上也有类似的教程。

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2016-6-3 22:59:05

在原有模型基础上，替换掉金属原子，不固定a,b,c;然后做结构弛豫，优化结束后得到a,b,c

xiongb123456 · 发表于 Post on 2016-6-4 14:34:40

灰飞的旋律发表于 2016-6-3 22:59
在原有模型基础上，替换掉金属原子，不固定a,b,c;然后做结构弛豫，优化结束后得到a,b,c

嗯这是一个很好的办法，但这个办法的前提是有原有的模型啊。
我想问的是如果没有原有模型的前提下（参考文献未提供），那么我应该如果设计构建这个模型呐?

谢谢您的回复 THX

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2016-6-4 17:37:13

xiongb123456 发表于 2016-6-4 14:34
嗯这是一个很好的办法，但这个办法的前提是有原有的模型啊。
我想问的是如果没有原有模型的前提下（参 ...

自己搭建或者晶体库导出或者加一些互助群向做过类似结构的群友求助

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[CASTEP/Dmol3/MS] 平面金属doping类石墨烯材料的建模问题

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