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[CP2K] CP2K程序后处理软件TAMkin的安装步骤

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本帖最后由 qzm 于 2023-1-9 13:38 编辑

TAMkin软件 为CP2K输出文件的后处理软件

以下为安装步骤:(确保服务器能联网)
1、上传 Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh 文件到服务器 (百度如何下载)
2、命令 sh Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh  反复单击回车键  直到出现Please answer 'yes' or 'no': 输入 yes
        出现  - Press ENTER to confirm the location    单击下 回车
3、命令 pip install numpy  
4、命令pip install tamkin
5、命令pip install nose
安装完成
最后测试 软件 命令  nosetests -v tamkin



TAMkin软件官网
http://molmod.github.io/tamkin/tutorial/install.html


nma-cp2k-v1.py

501 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 5

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发表于 Post on 2023-1-10 14:58:59 | 只看该作者 Only view this author
看了一下介绍
TAMkin is a post-processing toolkit for normal mode analysis, thermochemistry and reaction kinetics. It uses a Hessian computation from a standard computational chemistry program as its input. CHARMM, CP2K, CPMD, GAMESS, GAUSSIAN, QCHEM and VASP are supported. Multiple methods are implemented to perform a normal mode analysis (NMA). The frequencies from the NMA can be used to construct a molecular partition function to derive thermodynamic and kinetic parameters.

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