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[GROMACS] 求助:拟合二面角参数,怎么用Origin程序拟合二面角扭转项参数?

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你好!

我按照Sob老师的帖子拟合一个二面角的参数,帖子步骤如下:
1 用量子化学程序扫描二面角扭转势能曲线。参考《详谈使用Gaussian做势能面扫描》(http://sobereva.com/474
2 对当前体系照常产生拓扑文件,但是把那个二面角项去除,然后算(1)的扫描曲线上每个点的MM能量
3 将(1)的能量减去(2)的能量,剩下的部分就是纯粹应当由二面角扭转项描述的势能曲线。将这个作为被拟合对象,用Origin程序或自己写的程序拟合扭转项参数即可。


请问第3步的“用Origin程序拟合扭转项参数”,怎么做操作?
这样得到的二面角参数适合CHARMM力场吗?

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2#
发表于 Post on 2023-2-9 00:57:40 | 只看该作者 Only view this author
自己在origin建立个新函数,拟合时选择相应函数。不清楚的话google搜或者看帮助
对于各种力场都是共通的。搞清楚相应力场的函数形式、单位这些细节
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-9 10:01:56 | 只看该作者 Only view this author
谢谢卢老师答复!

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