LAMMPS学习资源整理

fatcharm · 发表于 Post on 2014-10-22 16:20:06

本帖最后由 fatcharm 于 2014-10-27 11:20 编辑

本帖仅作资料整理和经验总结，不再step by step的讲解，不定期更新，欢迎大家讨论和交流。

一、新手教程类
http://lammps.sandia.gov/tutorials.html

https://icme.hpc.msstate.edu/mediawiki/index.php/LAMMPS_tutorials

http://simulation.haotui.com/forum-38-1.html

二、安装编译类

三、建模相关
3.1 Packmol+VMD

3.2
Materials Studio
msi2lmp

3.3
Moltemplate

四、势函数总结

五、数据分析

5.1 轨迹文件可视化
VMD
AtomEye
OVITO

六、基础知识汇总

七、遇到难题的解决途径

7.1
http://lammps.sandia.gov/doc/Section_errors.html

尤其是12.3 Error & warning messages

7.2
查阅
http://lammps.sandia.gov/mail.html

fatcharm · 发表于 Post on 2014-10-22 17:12:31

占楼用1

fatcharm · 发表于 Post on 2014-10-22 17:12:37

占楼用2

fatcharm · 发表于 Post on 2014-10-22 17:12:42

占楼用3

ruanyang · 发表于 Post on 2014-10-24 07:41:46

顶超哥

truemantwo · 发表于 Post on 2014-10-24 10:26:38

在这里见到了“肥超”大侠，真是高兴。

从分子模拟论坛到这里，一晃许多年过去了。

truemantwo · 发表于 Post on 2014-10-24 10:30:35

我第一次编译成功并行版的lammps，所参考的Makefile就是fatcharm大侠给的，在此给大侠说声：谢谢！

516518 · 发表于 Post on 2014-11-3 07:26:38

多谢分享，整理的好，谢谢

haizhiwuyu · 发表于 Post on 2014-11-3 08:43:47

楼主，支持你经常更新完善本帖哟

413 · 发表于 Post on 2015-2-6 22:51:11

顶超神

kunkun · 发表于 Post on 2015-2-7 23:53:19

顶ding顶！

holgrove · 发表于 Post on 2015-2-8 00:39:58

多谢分享

xulisky · 发表于 Post on 2015-8-14 09:24:42

确实好有用

w123456 · 发表于 Post on 2019-3-25 20:51:22

感谢楼主的分享，很实用

牛很牛 · 发表于 Post on 2019-4-16 15:25:39

大神，我想问一个问题。也是困扰了很久问题，每次我进行建模计算的过程中，非常频繁的出现报错就是out of range atoms - cannot compute PPPM。之前一直按照我师兄教我的办法去减小步长去进行计算。但是每次都是治标不治本，尽管可以进行几步的计算，但是最后依然会是抱这个错，想知道对应这个报错，有什么可以从根本上解决掉他的办法吗？非常感谢

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