有没有办法让石墨烯或碳纳米管在允许它运动的前提下让它不变形？

cavalier · 发表于 Post on 2020-4-18 12:39:13

如题，我的体系内石墨烯平面或者碳纳米管也一样，是可以在水环境里运动的，以前我是通过冻结或位置约束让它保持完美的初始形状的，但是现在为了让它可以在水中乱跑、运动，肯定不能冻结和位置约束了，结果就发生了正常的变形了，感觉很难看

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2020-4-18 13:06:34

没懂你想要它如何运动。冻结纳米管内的相对位置？

sobereva · 发表于 Post on 2020-4-18 13:54:13

gmx里没有办法完美实现这点，能做的一般也就是调整二面角参数令管子或石墨烯刚性增强

cavalier · 发表于 Post on 2020-4-18 14:29:16

关于2#的回答，我的研究是，多个碳纳米管或碳平面当成纳米杂质，漂浮在水环境内，所以是要观察它们的漂浮聚集之类的。所以你的理解也没错，希望冻结纳米管内的相对位置，这样就不会变的扭曲、参差不齐了，毕竟这样比较难看，难以做图。而且印象里以前看别人的文章，对于这个类悬浮着的纳米颗粒，好像结构都是比较理想的几何结构。

感谢3#的sob老师，其实我本来想来想去好像只有通过增强itp里的键参数来实现，担心会不会有更好的方法，现在放心了！

dark_cosmos · 发表于 Post on 2020-4-18 14:31:12

gromacs如果不好实现可以试试lammps，纳米管+水得体系很简单，lammps中fix rigid可以实现你的目的

cavalier · 发表于 Post on 2020-4-18 17:55:25

dark_cosmos 发表于 2020-4-18 14:31
gromacs如果不好实现可以试试lammps，纳米管+水得体系很简单，lammps中fix rigid可以实现你的目的

谢谢！

1416339770 · 发表于 Post on 2023-2-11 19:52:05

贴主，请问你运动组不变形的问题解决了吗，是如何解决的呢

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[GROMACS] 有没有办法让石墨烯或碳纳米管在允许它运动的前提下让它不变形？

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