计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 470|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 如何验证Multiwfn的计算结果?

[复制链接 Copy URL]

23

帖子

0

威望

188

eV
积分
211

Level 3 能力者

第一次接触Multiwfn和计算化学。

我用主功能1得到了某分子上一个原子的性质,包括Density of electrons, ESP from nuclear charges, 等等。。

我的问题是,假定我的输入文件内容正确(一个valid molecule构成的pdb文件),有什么办法验证Multiwfn的计算结果与实际相符吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-2-1 09:41:05 | 只看该作者 Only view this author
pdb文件没波函数信息,不可能计算电子密度(除非你计算的是准分子近似的电子密度)

充分搞清楚计算原理,自然就没这种疑惑

使用Multiwfn做波函数分析是必须建立在有量子化学计算常识的基础上的,如果连这些常识都没有,看下文
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

23

帖子

0

威望

188

eV
积分
211

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-1 09:56:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-1 09:41
pdb文件没波函数信息,不可能计算电子密度(除非你计算的是准分子近似的电子密度)

充分搞清楚计算原理 ...

我计算的是分子上一个原子的电子密度,这需要波函数信息吗?

112

帖子

0

威望

882

eV
积分
994

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2024-2-1 18:40:06 | 只看该作者 Only view this author
Yuuya 发表于 2024-2-1 09:56
我计算的是分子上一个原子的电子密度,这需要波函数信息吗?

需要的
不羡大神不羡仙,努力学习每一天

23

帖子

0

威望

188

eV
积分
211

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-1 19:41:03 | 只看该作者 Only view this author

我现在的情况是,我有pdb文件,跑过Gaussian的opt+freq后生成的chk和gjf文件,我将这三个文件分别放入multiwfn后运行主功能1并通过序号选择具体原子后,三个文件均可分析并在电子密度这一计算结果上完全一致。

如果需要波函数信息,为什么在分析时没有报错呢?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-2-2 01:52:31 | 只看该作者 Only view this author
Yuuya 发表于 2024-2-1 19:41
我现在的情况是,我有pdb文件,跑过Gaussian的opt+freq后生成的chk和gjf文件,我将这三个文件分别放入mul ...

输入文件没波函数信息的时候自动给你准分子近似(promolecular)的电子密度,仔细看屏幕上的提示

认真把此文看了,别瞎试
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 07:29 , Processed in 0.183798 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list