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[GROMACS] 关于gmx hbond氢键计算的问题

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请问下各位老师,我用gmx hbond计算氢键,使用-ac,输出了这个xvg文件,想问下红色下划线的这四个参数都是什么意思?谢谢

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发表于 Post on 2023-2-22 04:18:33 | 只看该作者 Only view this author
在grace里对xvg绘图,看图例内容便知
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-22 10:26:42 | 只看该作者 Only view this author
好的,sob老师,我想再请教下,计算氢键的自相关函数值是负的,是不是有问题?以及用自相关函数表示氢键的寿命能用于蛋白---蛋白之间吗?因为我看了好多文献都是用在蛋白和水之间的

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发表于 Post on 2023-2-23 20:03:52 | 只看该作者 Only view this author
楼主好 ,我想请教一下你算氢键用的命令脚本,能不能教教我,小白想学

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