模拟报错，出现“FATAL ERROR: UNABLE TO FIND ANGLE PARAMETERS FOR CN8 HN8 CN8”

爱人只爱辣辣米 · 发表于 Post on 2024-2-23 21:32:24

一跑NAMD就出现这个错误，我的psf文件是用VMD的AutoPSF插件生成的，
报错的原子都属于同一个ADE残基，
是因为拓扑文件没有这个键才报错吗

爱人只爱辣辣米 · 发表于 Post on 2024-2-24 17:33:34

问题已经解决了；
是PSF文件里BOND键重复了，删掉就好了。

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[NAMD] 模拟报错，出现“FATAL ERROR: UNABLE TO FIND ANGLE PARAMETERS FOR CN8 HN8 CN8”