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[Gaussian/gview] gaussian计算电解液中单个溶剂分子与离子之间结合能求助

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各位老师,我现在想用gaussian计算1M LiFSI/DME 电解液中,单个溶剂分子DME与Li离子之间的结合能,具体计算流程是要怎么实现?感谢老师解惑!

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发表于 Post on 2022-5-5 08:30:38 | 只看该作者 Only view this author
最糙的做法,结合Li+的DME的能量减去Li+的能量再减去DME的能量,复合物和DME分别优化。优化和能量计算都在隐式溶剂模型下进行

然而靠隐式溶剂模型没法把Li+在DME中的状态描述得较准确,对精度有一定要求的情况下应当考虑显式溶剂
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-5 10:09:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-5 08:30
最糙的做法,结合Li+的DME的能量减去Li+的能量再减去DME的能量,复合物和DME分别优化。优化和能量计算都在 ...

谢谢老师的解答,那在做锂离子,DME,和Li+DME优化时,是否都要在溶剂环境下?溶剂模型是都要用DME吗?

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发表于 Post on 2022-5-5 14:37:29 | 只看该作者 Only view this author
yangzhanlin 发表于 2022-5-5 10:09
谢谢老师的解答,那在做锂离子,DME,和Li+DME优化时,是否都要在溶剂环境下?溶剂模型是都要用DME吗?

兄弟,你为什么只需要考虑一个溶剂分子呢,锂不是四配位吗

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发表于 Post on 2022-5-5 20:18:46 | 只看该作者 Only view this author
yangzhanlin 发表于 2022-5-5 10:09
谢谢老师的解答,那在做锂离子,DME,和Li+DME优化时,是否都要在溶剂环境下?溶剂模型是都要用DME吗?

Li+根本没法优化
DME本身不需要非得在溶剂模型下优化,但为了统一,DME和Li+DME都在溶剂模型下优化。
但这么计算虽然省事但实在不准,没多大实际意义。

我建议你把真空下计算的[Li(DME)n-1]+ + DME -> [Li(DME)n]+的能量变化当做你要求的结合能。其中[Li(DME)n]+可以用genmer+molclus做构型搜索得到,看《genmer:生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具》(http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html)和molclus主页(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)里的相关信息;也可以给Li+周围包上一层DME然后用xtb在GFN-xTB级别下跑动力学产生一批初始结构,然后再用molclus优化和筛选出能量最低的Li(DME)n构型。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-8 15:22:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-5 20:18
Li+根本没法优化
DME本身不需要非得在溶剂模型下优化,但为了统一,DME和Li+DME都在溶剂模型下优化。
...

好的,谢谢老师的解答

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-8 15:24:01 | 只看该作者 Only view this author
付之一生 发表于 2022-5-5 14:37
兄弟,你为什么只需要考虑一个溶剂分子呢,锂不是四配位吗

我是看文献中是这么做的

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发表于 Post on 2022-5-8 15:47:15 | 只看该作者 Only view this author
yangzhanlin 发表于 2022-5-8 08:24
我是看文献中是这么做的

文献研究的是溶液相还是气相?有的时候文献可能研究的是气相团簇,也就是气相里一个裸露的Li+和一个DME分子的结合,此时如果你要研究电解液就不能简单照搬文献的做法。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-5-14 21:04:02 | 只看该作者 Only view this author
yangzhanlin 发表于 2022-5-8 15:24
我是看文献中是这么做的

兄弟,能留个联系方式吗

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发表于 Post on 2022-5-28 16:24:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-5 20:18
Li+根本没法优化
DME本身不需要非得在溶剂模型下优化,但为了统一,DME和Li+DME都在溶剂模型下优化。
...

老师,这个包一层DMF是什么意思,是建模的时候随机在Li+周围填满dmf吗

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发表于 Post on 2022-5-30 05:42:14 | 只看该作者 Only view this author
付之一生 发表于 2022-5-28 16:24
老师,这个包一层DMF是什么意思,是建模的时候随机在Li+周围填满dmf吗

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发表于 Post on 2023-2-28 23:06:03 | 只看该作者 Only view this author
道友,方便留个联系方式嘛,

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