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[新手求助] g16优化甜菜碱离子,生成的结构很奇怪

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楼主
请问使用b3lyp/6-311g的优化方法进行优化,生成的几何结构如图所示

2023-03-13 10-05-09屏幕截图.png (29.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

2023-03-13 10-05-09屏幕截图.png

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计算化学路人甲

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发表于 Post on 2023-3-13 11:59:27 | 只看该作者 Only view this author
应该是你初始结构给的极度不合理,如果不懂得合理结构怎么构建,这种已知分子可以网上搜一下相关数据库,就能给你比较好的初始结构。
我搜了下PubChem,里面有此分子晶体结构对应的信息(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/247

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发表于 Post on 2023-3-13 12:31:39 | 只看该作者 Only view this author
PBE0/def2-TZVP优化的

甜菜碱阳离子-PBE0def2TZVP.xyz

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发表于 Post on 2023-3-13 21:14:09 | 只看该作者 Only view this author
别用6-311G这种搞笑的基组,好好看此文再做计算
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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