求助：使用gmx_MMPBSA计算能量贡献之前，需要对GPU跑出来的轨迹rerun一下吗

Aswau

蛋白质配体复合物模拟，先是用了Gromacs GPU加速跑出了轨迹，然后直接对轨迹进行了周期性校正，再得到了RMSF、RMSD、Rg等结果。
现在想要根据轨迹使用gmx_MMPBSA计算能量贡献，请问需要对GPU跑出来的轨迹进行rerun吗？
如果要rerun的话，rerun的轨迹是周期性校正前还是后的呢？RMSF等结果针对的也该是rerun后的轨迹吗？
谢谢。