计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 954|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 求助萃取剂和共沸物的范德华表面静电势计算分析

[复制链接 Copy URL]

78

帖子

0

威望

323

eV
积分
401

禁止发言

提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120081

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-3-17 23:08:01 | 只看该作者 Only view this author
虽然第二个共沸物表面静电势最正的地方比第一个更正,但周围很大部分静电势都不正,而且还有显著的位阻效应,所以不能光靠静电势最大值判断

这个体系不大,应当先用molclus+genmer(http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html)做构型搜索得到最稳定二聚体构型,然后基于实际结合的构型再去用单体的表面静电势互补性来考察
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1万

帖子

0

威望

8969

eV
积分
20713

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2023-3-19 16:39:17 | 只看该作者 Only view this author
决定多氟代/全氟代化合物与其他化合物的非共价相互作用的,往往是色散相互作用而非静电相互作用。所以不能只看静电势
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

78

帖子

0

威望

323

eV
积分
401

禁止发言

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-24 11:51:13 | 只看该作者 Only view this author
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

78

帖子

0

威望

323

eV
积分
401

禁止发言

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-24 11:51:26 | 只看该作者 Only view this author
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

78

帖子

0

威望

1510

eV
积分
1588

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2023-3-24 15:46:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-19 16:39
决定多氟代/全氟代化合物与其他化合物的非共价相互作用的,往往是色散相互作用而非静电相互作用。所以不能 ...

请教一下,怎样判断两个物质之间的非共价作用是以色散相互作用为主呢,还是以静电相互作用为主?谢谢!

1万

帖子

0

威望

8969

eV
积分
20713

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2023-3-24 16:14:54 | 只看该作者 Only view this author
vigaryang 发表于 2023-3-24 08:46
请教一下,怎样判断两个物质之间的非共价作用是以色散相互作用为主呢,还是以静电相互作用为主?谢谢!

计算上的方法就是做能量分解分析。但是对于足够常见的物质,比如这里的全氟代化合物,不用计算就应该知道,因为这属于常识
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

78

帖子

0

威望

1510

eV
积分
1588

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on 2023-3-24 17:07:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-24 16:14
计算上的方法就是做能量分解分析。但是对于足够常见的物质,比如这里的全氟代化合物,不用计算就应该知道 ...

谢谢!周期性体系中的相互作用也能做能量分解分析么?

1万

帖子

0

威望

8969

eV
积分
20713

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2023-3-24 17:39:01 | 只看该作者 Only view this author
vigaryang 发表于 2023-3-24 10:07
谢谢!周期性体系中的相互作用也能做能量分解分析么?

可以,但支持这个的程序可能较少,参见http://bbs.keinsci.com/forum.php ... C%C1%BF%B7%D6%BD%E2
不过绝大多数周期性体系能量分解分析问题都可以抠出来一个簇,转化成孤立体系问题来研究
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

78

帖子

0

威望

1510

eV
积分
1588

Level 5 (御坂)

10#
发表于 Post on 2023-3-24 21:11:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-3-24 17:39
可以,但支持这个的程序可能较少,参见http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=32150&high ...

收到,非常感谢!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-13 04:38 , Processed in 0.183736 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list