计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12085|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 用含赝势基组的混合基组得到的单点能与用全电子基组得到的单点能有可比性吗

[复制链接 Copy URL]

25

帖子

0

威望

1367

eV
积分
1392

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 believeht 于 2016-6-24 20:22 编辑

目的是想比较两组反应活化能大小,在计算单点能时有点困惑,希望大家能给点意见:
第一组反应包含K、H、C、O、Si元素,
优化水平:B3LYP/6-31g(d)
单点能计算水平:B3LYP/6-311+g(2d,p);

第二组反应包含Rb、H、C、O、Si元素,
优化水平:
H C O Si 0
6-31G(d)
****
Rb 0
LANL2DZ
****

Rb 0
LANL2DZ

单点能计算水平:
H C O Si 0
6-311+g(2d,p)
****
Rb 0
LANL2DZ
****

Rb 0
LANL2DZ



本人计算出来的结果是,第二组的单点能明显偏高。
虽然同一组反应用相同的基组,计算活化能时也只是组内不同构型的单点能+零点能的比较。但心里还是有疑惑这样做是否可行。

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2016-6-24 22:56:52 | 只看该作者 Only view this author
这两个体系实际上用了相同的水平(可以理解为对第一个中不存在的Rh也使用了赝势),若计算合理,算出的反应能变、活化能等可以相互比较。

这两组的元素组成都不一样,比较单点能的大小没有意义。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2016-6-24 23:32:16 | 只看该作者 Only view this author
两组分子元素都不同,比较能量高低没有意义。

对同一组内比较能量的时候,这两组用你说的基组是可以的。
但一个问题是,对K用6-311+g(2d,p),对Rb却用Lanl2DZ,显得太小了。你比较一下Lanl2DZ和6-311+g(2d,p)对K的定义就看得出来。对Rb起码用lanl08。另外,给碱金属用弥散没任何意义。

最好的选择是,优化时候所有原子都用def2SVP,单点计算时候都用def2TZVP,直接统一起来。def2对于你牵扯到的这些元素都有定义。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

25

帖子

0

威望

1367

eV
积分
1392

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-25 00:22:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 believeht 于 2016-6-25 00:26 编辑
sobereva 发表于 2016-6-24 23:32
两组分子元素都不同,比较能量高低没有意义。

对同一组内比较能量的时候,这两组用你说的基组是可以的。 ...

谢谢老师指点,在计算第二组反应时,我可以优化时对Rb用Lanl2DZ,计算单点能时对Rb用lanl08吗?
因为其实还有其他一些文件,并且所有文件已经对Rb用Lanl2DZ优化完毕,重新用lanl08或者def2SVP寻找过渡态、优化一遍需要大量时间。
因为对基组的了解不够,所以才会选用基组不当,再次谢谢Sob

25

帖子

0

威望

1367

eV
积分
1392

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-25 00:25:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 believeht 于 2016-6-25 00:37 编辑
liyuanhe211 发表于 2016-6-24 22:56
这两个体系实际上用了相同的水平(可以理解为对第一个中不存在的Rh也使用了赝势),若计算合理,算出的反应 ...

谢谢指点。其实我最大的疑惑正像Sob老师说的,在计算单点能时,对K用6-311+g(2d,p),而对Rb用LANL2DZ,这是不合适的。假如帖子的题目改为“用含赝势基组的混合基组得到的活化能与用全电子基组得到的活化能有可比性吗”会表达得更清楚一点。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2016-6-25 02:26:28 | 只看该作者 Only view this author
believeht 发表于 2016-6-25 00:22
谢谢老师指点,在计算第二组反应时,我可以优化时对Rb用Lanl2DZ,计算单点能时对Rb用lanl08吗?
因为其 ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 05:17 , Processed in 0.157369 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list