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[ORCA] 请问orca可以做半经验计算优化吗

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楼主
老师好,我看的文献中提到使用 Amber Tools 里的 Antechamber 模块产生上述分子基于 AM1 半经验计算优化后的结构文件和拓扑信息文件,我想请教下可不可以用orca来做半经验计算优化,具体怎么做?

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发表于 Post on 2023-4-25 15:28:48 | 只看该作者 Only view this author
当然可以,优化关键词都是一样的,方法写AM1就行了,不需要基组

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-25 16:17:57 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2023-4-25 15:28
当然可以,优化关键词都是一样的,方法写AM1就行了,不需要基组

请问网站上有具体教程吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-25 16:21:15 | 只看该作者 Only view this author
ngaoo 发表于 2023-4-25 16:17
请问网站上有具体教程吗

再问您一下,用orca做半经验优化是可以出结构文件和top文件的吧

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发表于 Post on 2023-4-25 17:21:10 | 只看该作者 Only view this author
ngaoo 发表于 2023-4-25 16:17
请问网站上有具体教程吗

查ORCA手册就行,和其他优化完全一样的

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发表于 Post on 2023-4-25 23:55:14 | 只看该作者 Only view this author
ngaoo 发表于 2023-4-25 16:21
再问您一下,用orca做半经验优化是可以出结构文件和top文件的吧

ORCA显然不会给出top文件
搞清楚各个程序是干什么的,描述的时候必须严谨、准确

单纯做半经验级别的优化,装个xtb或MOPAC,分别做GFN-xTB和PM7级别的优化,速度会更快,也明显好于AM1
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-4-26 00:01:22 | 只看该作者 Only view this author
补充一句,xtb既是一个程序的名字,也是一系列半经验方法(GFN0-xTB, GFN1-xTB, GFN2-xTB)的统称。既可以用xtb程序做xtb级别的优化,也可以从ORCA调用xtb程序做xtb级别的优化,后者在过渡态搜索、AIMD(尤其是metadynamics)等方面有一定优势。正如sob老师所说,AM1已经严重过时了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-26 10:02:28 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-26 00:01
补充一句,xtb既是一个程序的名字,也是一系列半经验方法(GFN0-xTB, GFN1-xTB, GFN2-xTB)的统称。既可以 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-26 10:02:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-25 23:55
ORCA显然不会给出top文件
搞清楚各个程序是干什么的,描述的时候必须严谨、准确

谢谢老师

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