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[综合交流] 求助:中性团簇中,分子间氢键强度和该氢键长度的关系是:氢键越强键长越短吗?

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楼主
老师们好!
在理论计算的过程中,发现有分子间氢键的长度相差不大,在GaussView 6.0中查看两氢键键长分别是1:2.82797Å;2:2.82856Å。但是用http://sobereva.com/522 博文《计算分子内氢键键能的几种方法》中方法1、 基于键临界点的电子密度估计内氢键键能 得到的键能分别约为(转换为kJ,且保留到小数点两位)1:-1.48kJ/mol,2:-2.90kJ/mol
请教各位老师,这个计算是否有效呢?如果结果可能是正确的话,那么可能是什么原因导致这种键长和键能不一致的情况呢?

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发表于 Post on 2020-10-1 17:03:21 | 只看该作者 Only view this author
这个一点也不奇怪
首先,键长只有差别在0.01埃甚至0.02埃以上才能用来讨论,你的计算结果只能说明1的氢键键长和2类似,不能说1比2短,这已经小于你的计算方法的误差范围了;
其次,不管键长还是键临界点的电子密度,都只是和氢键强度在统计上有显著相关性,并不是必然联系。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2020-10-1 19:07:13 | 只看该作者 Only view this author
两者是否完全是同一类型的氢键,键角是多少?这些都没说清楚。
氢键的强度并不只与键长有关系,很多时候键角的影响会更大。

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发表于 Post on 2020-10-1 20:31:08 | 只看该作者 Only view this author
键长几乎相同,BCP电子密度能差那么多,在我来看很不可思议。最好直接贴个图,省得别人猜了。另外,氢键键能居然那么小,这种情况也很少见。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-10-2 10:19:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-1 20:31
键长几乎相同,BCP电子密度能差那么多,在我来看很不可思议。最好直接贴个图,省得别人猜了。另外,氢键键 ...

而且键长太长了,是不是氢键都存疑
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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