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[GROMACS] gromacs计算氢键问题

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老师您好,我在复现培训班泛素(1UBQ)模拟案例计算氢键的时候,输入命令之后,gmx出现如下报错,想请教一下这是为什么?

屏幕截图 2023-05-14 180143.png (67.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

屏幕截图 2023-05-14 180143.png

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发表于 Post on 2023-5-14 19:29:30 | 只看该作者 Only view this author
gromacs版本问题,目前北京科音分子动力学与GROMACS培训班里用的gromacs 2018.8
尝试分多次执行,每次带不同的选项
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-15 08:48:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-14 19:29
gromacs版本问题,目前北京科音分子动力学与GROMACS培训班里用的gromacs 2018.8
尝试分多次执行,每次带不 ...

好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2023-5-16 21:45:27 | 只看该作者 Only view this author
尝试每个指令后面指定一个输出文件,比如-ang angle.xvg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-28 13:40:58 | 只看该作者 Only view this author
Jotaro 发表于 2023-5-16 21:45
尝试每个指令后面指定一个输出文件,比如-ang angle.xvg

好的。谢谢

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