求助：警告，范德华半径未指定

lapulasi

这是我的命令

echo 6 | gmx pdb2gmx -f rec.pdb -o rec_processed.gro  -ignh 1 #选择的AMBER99SB-ILDN 力场
gmx editconf -f rec_processed.gro -o newbox.gro -bt cubic -d 1.0
gmx solvate -cp newbox.gro -cs spc216.gro -p topol.top -o solv.gro

在最后一个命令时，有一个警告
Initialising inter-atomic distances...

WARNING: Masses and atomic (Van der Waals) radii will be guessed
         based on residue and atom names, since they could not be
         definitively assigned from the information in your input
         files. These guessed numbers might deviate from the mass
         and radius of the atom type. Please check the output
         files if necessary. Note, that this functionality may
         be removed in a future GROMACS version. Please, consider
         using another file format for your input.
想问一下各位老师，这个警告怎么才能解决。
rec.pdb是一个蛋白，没有其他的非标准氨基酸

student0618

不用理会，真是担心就vmd检查一下有没有跑到不该有的地方。