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[ORCA] 不知道是不是安装的ORCA 有问题 还是MPI?或者服务器其他问题

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楼主
如题,不知道是不是安装成功了ORCA, 不知道中止的原因是什么?求问

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发表于 Post on 2023-5-25 18:32:18 | 只看该作者 Only view this author
比较可能是openmpi没装对
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-5-26 02:24:59 | 只看该作者 Only view this author
没装MPI库,或者当前活动状态的不是OpenMPI而是诸如Intel MPI,或者用的不是当前ORCA版本兼容的OpenMPI版本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-26 11:32:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-26 02:24
没装MPI库,或者当前活动状态的不是OpenMPI而是诸如Intel MPI,或者用的不是当前ORCA版本兼容的OpenMPI版本

感谢回答,正在寻找问题,安装了最新的OPENMPI 4.1.1,取运行ORCA 还是有问题,还在寻找解决办法

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-26 11:47:46 | 只看该作者 Only view this author
可以把前文的$PATH:/sob/openmpi411/bin改为/sob/openmpi411/bin:$PATH、把$LD_LIBRARY_PATH:/sob/openmpi411/lib改为/sob/openmpi411/lib:$LD_LIBRARY_PATH,  参考了这个  ,然后可以运行了

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发表于 Post on 2023-5-27 23:35:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kimariyb 于 2023-5-27 23:52 编辑
valentino_bo 发表于 2023-5-26 11:47
可以把前文的$PATH:/sob/openmpi411/bin改为/sob/openmpi411/bin:$PATH、把$LD_LIBRARY_PATH:/sob/openmpi4 ...

楼主,你所说的这个东西,如果你从来没有配置过,$PATH写前面和后面,执行的结果应该是一样的。写前面和后面的区别,主要是 Linux 系统读取配置文件的顺序不同所导致的。

  1. # openMPI
  2. export PATH=$PATH:/home/kimariyb/orca/openmpi-4.1.1/bin
  3. export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/kimariyb/orca/openmpi-4.1.1/lib
  4. # orca
  5. export PATH=$PATH:/home/kimariyb/orca/orca5
  6. export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/kimariyb/orca/orca5
复制代码

我这样配置,照样也能运行。如果如你所说你把 $PATH 写前面运行出错,应该是服务器之前有过别的的配置,导致 Linux 没有读取你的新配置,不过楼主也不必认为 $PATH 写在前面就是错误写法,如果是一台全新的机子,并且系统够干净,写前面和后面应该是没区别的。
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
School of Electronic Science and Engineering (National Model Microelectronics College)
Research interests: theoretical and computational chemistry and machine learning

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-1 09:53:00 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2023-5-27 23:35
楼主,你所说的这个东西,如果你从来没有配置过,$PATH写前面和后面,执行的结果应该是一样的。写前面和 ...

对的, 是服务器本来之前就有intel MPI 。

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