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[Gaussian/gview] 较大体系多个分子结构优化和频率分析的基组选择问题

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想用Gaussian计算多个分子,如下图所示,(gjf文件如下,大约一共有170个原子,分子元素为C、H、O)的opt+fre,之后用于计算结合能和静电势的分析,使用的超算平台,核数为256,尝试过用b3lyp/6-311g(d,p),但是耗时很长,而且算出来会有非常多的小虚频,很难消除,所以想问问这种体系可以用Gaussian算吗,如果可以,应该选用什么基组呢?有没有其他更好的软件计算这种体系呢?

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OA_menthol_BHET.gjf

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发表于 Post on 2023-6-20 19:51:33 | 只看该作者 Only view this author
可以考虑用ORCA的B97-3c等方法,开RI以后计算很快。此外注意构象搜索问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-6-20 20:01:44 | 只看该作者 Only view this author
不要把freq写成fre

先用GFN-xTB或者PM6-D3H4做预优化,然后b3lyp-D3(BJ)/6-31G*优化,当前计算条件算这体系根本没难度
用B3LYP不带D3优化这个是开玩笑,好好看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

虚频该怎么消怎么消。本来弱相互作用体系就容易出虚频,我推荐的这个级别已经是属于最不容易出虚频的级别范畴里的了,换其它的也不会有任何好处。
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278http://bbs.keinsci.com/thread-633-1-1.html


原则上来说需要结合molclus(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)等程序做构型/构象搜索。至于实际是否需要,看具体研究目的,如果构象搜索做不做对研究的问题影响不大可以忽略此问题
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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