计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1006|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 用Multiwfn做MFDD时吸引子的数值与相应区域的大小不一致的原因是什么?

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

335

eV
积分
348

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 小新人 于 2023-6-26 20:15 编辑

想请教下各位老师,用Multiwfn做MFDD时吸引子的数值与相应区域的大小不一致的原因是什么?如下图所示箭头所指的区域,它吸引子的数值为0.02

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120201

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-6-26 23:21:35 | 只看该作者 Only view this author
你都没说作图时isovalue取的多少,此问题没意义

而且在Multiwfn里MFDD吸引子怎么算的必须完整说清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

13

帖子

0

威望

335

eV
积分
348

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-27 09:24:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小新人 于 2023-6-27 09:28 编辑
sobereva 发表于 2023-6-26 23:21
你都没说作图时isovalue取的多少,此问题没意义

而且在Multiwfn里MFDD吸引子怎么算的必须完整说清楚

sob老师,作图时isovalue取的是±0.0012,用Multiwfn里MFDD吸引子是用电子密度差的盆分析算的。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120201

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-6-28 00:02:31 | 只看该作者 Only view this author
小新人 发表于 2023-6-27 09:24
sob老师,作图时isovalue取的是±0.0012,用Multiwfn里MFDD吸引子是用电子密度差的盆分析算的。

还是没说清楚MFDD计算的具体操作。本来MFDD就不是Multiwfn官方的标准功能,手册里搜MFDD都搜不到东西

你图中的等值面是一大块,其等值面数值和里面包裹的某个点的具体数值有明显差异是正常的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

13

帖子

0

威望

335

eV
积分
348

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-28 10:08:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小新人 于 2023-6-28 10:10 编辑
sobereva 发表于 2023-6-28 00:02
还是没说清楚MFDD计算的具体操作。本来MFDD就不是Multiwfn官方的标准功能,手册里搜MFDD都搜不到东西

...

抱歉老师,这是我算MFDD吸引子的步骤

步骤.zip

2.03 MB, 下载次数 Times of downloads: 7

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120201

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2023-6-29 00:26:33 | 只看该作者 Only view this author
把MFDD全称给清楚,我始终不知道你说的MFDD具体指什么。感觉你只不过是对密度差做常规的盆分析而已

你的步骤最后计算的是盆积分,我不知道你是否读的是吸引子位置处的具体函数值

搜索完吸引子之后,用Multiwfn主功能0看内存里当前格点数据的等值面图,并且调节isovalue,能帮助你了解函数分布情况。也自然能明白吸引子的位置、数值是怎么来的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

13

帖子

0

威望

335

eV
积分
348

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-29 09:13:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-29 00:26
把MFDD全称给清楚,我始终不知道你说的MFDD具体指什么。感觉你只不过是对密度差做常规的盆分析而已

你的 ...

好的老师,我再研究研究,MFDD是分子生成密度差,麻烦老师了,非常感谢老师。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 05:26 , Processed in 0.186046 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list