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[GROMACS] DCOM、Coul-SR、LJ-SR随时间变化的图应该怎么做?

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老师,我想问一下这个质心距离(DCOM: )这个图(图中是多酚小分子和猪胰腺淀粉酶蛋白模拟)应该怎么做啊,是用代码吗,还有这个DCOM,[size=7.173pt]Coul-SR(short
[size=7.173pt]range Coulomb interaction energy), LJ-SR(short range Lennard-Jones potential)这三个参数在这个蛋白小分子中代表什么,能说明什么问题啊,查了文献也没查到介绍。

DCOM.jpg (520.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

DCOM.jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-7 16:15:36 | 只看该作者 Only view this author
DCOM: distance of center of masses:质心距离
Coul-SR:short range Coulomb interaction energy
LJ-SR:short range Lennard-Jones potential
这三个参数是这个,上传了好像没显示出来

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发表于 Post on 2023-7-8 10:16:38 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “DCOM、Coul-SR、LJ-SR” 改了,以后务必注意

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
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发表于 Post on 2023-7-8 10:18:55 | 只看该作者 Only view this author
GROMACS里用gmx distance计算质心距离随时间的变化
分清楚命令和代码,别随便用代码这个词

结合语境。像样的文章里不可能没清楚解释画的是什么东西。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-8 18:13:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-8 10:18
GROMACS里用gmx distance计算质心距离随时间的变化
分清楚命令和代码,别随便用代码这个词

好的,谢谢老师,我再仔细地去看一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-10 09:55:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-8 10:16
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的老师

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