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[硬件] 哪位老哥知道哪家超算机构有单机内存4TB以上的节点?

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楼主
本帖最后由 rugals 于 2023-8-22 12:49 编辑

如题

跑cp2k,体系比较大,内存不怎么够用。

谢谢楼下各位老哥,这里补充点细节:
想用cp2k做千原子体系的杂化泛函计算,要做电子结构分析,对精度有要求,且不能用OT、ADMM、LSSCF等技术。
想尽量保证能让所有ERI存到内存里而不是on-the-fly方式。
目前正在用并行的2T内存节点做试验。(硬盘空间2.5T,某楼说的没错,现在确实是2毛/核时)
还不够的话只能考虑跨节点运行了。

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发表于 Post on 2023-8-22 00:44:42 | 只看该作者 Only view this author
你确定说的是内存? 不是硬盘空间?

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小屁孩

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发表于 Post on 2023-8-22 01:04:50 | 只看该作者 Only view this author
即使能找到这种机器,大概率你的体系最终还是跑不动

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- 向着虚无前进 -

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发表于 Post on 2023-8-22 05:34:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 一颗赛艇 于 2023-8-22 05:37 编辑

现在感觉DDR3 reg 内存,比如32G一条的比较便宜,你可以试试组一个4路的洋垃圾

我见过惠普有一款,DL580 G8,12*8条插满可以做到3TB内存,要再往上的话就得DDR4了,不过那样会很贵

话说回来你要算啥?感觉你的计算方案可能有问题。

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5#
发表于 Post on 2023-8-22 05:38:30 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-8-22 00:44
你确定说的是内存? 不是硬盘空间?

一般集群硬盘空间可比4TB大得多了

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发表于 Post on 2023-8-22 09:00:31 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2023-8-22 01:04
即使能找到这种机器,大概率你的体系最终还是跑不动

我觉得不是大概率跑不动,是一定跑不动。需要4TB缓存的体系,单节点最强现在也就是amd9654这类,根本扛不动。

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石墨

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发表于 Post on 2023-8-22 10:34:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Graphite 于 2023-8-22 10:37 编辑

确实有128/256核带4T内存的节点这种东西,是面向一些特殊行业定制的内存特化版,CPU同比通常计算节点弱得很。
就算找朋友找代理弄到了,价格估计也感人,一天上千都有可能。有这钱不如裁裁体系,重新设计下,有需要像楼上说的弄个几千块钱洋垃圾慢慢算着。
镜像空间计算模拟

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石墨

8#
发表于 Post on 2023-8-22 10:34:19 | 只看该作者 Only view this author
确实有128/256核带4T内存的节点这种东西,是面向一些特殊行业定制的内存特化版,CPU同比通常计算节点弱得很。

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镜像空间计算模拟

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9#
发表于 Post on 2023-8-22 11:55:12 | 只看该作者 Only view this author
没有打广告,找并行咨询过,有2TB内存的机子,不过价格快2毛每核时了,最后没舍得用

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发表于 Post on 2023-8-22 12:15:47 | 只看该作者 Only view this author
需要搞清楚的问题:
1 是否是计算过程中, 内存不足? 一般调度器会报告oom, out of memory。
2 难道是磁盘读写空间不足? 一般提示信息大概是 out of space, out of disk space之类。

楼上讲的没错, 一般的集群, 硬盘空间至少比4TB多。

问题是,当前用户被授权使用的配额是多少?
有没有可能, 硬件资源是够用的,
但是当前的用户, 被限定, 最多使用内存500GB, 计算读写硬盘空间1TB, 数据存储空间100GB?
这种多层面的限定是可能存在的。


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-22 12:45:39 | 只看该作者 Only view this author
各位老哥好,不一一回复了

想用cp2k做千原子体系的杂化泛函计算,要做电子结构分析,对精度有要求,且不能用OT、ADMM、LSSCF等技术。
想尽量保证能让所有ERI存到内存里而不是on-the-fly方式。
目前正在用并行的2T内存节点做试验。(硬盘空间2.5T)
还不够的话只能考虑跨节点运行了。

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发表于 Post on 2023-8-22 13:18:09 | 只看该作者 Only view this author
合理搭配openMP + MPI 可以降低内存压力。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-22 14:48:29 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2023-8-22 13:18
合理搭配openMP + MPI 可以降低内存压力。

谢谢老师,我配的8MPI进程,每个下属8个openMPI。内存耗量时高时低。

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发表于 Post on 2023-8-22 15:50:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2023-8-22 15:51 编辑
且不能用OT、ADMM、LSSCF等技术。
想尽量保证能让所有ERI存到内存里而不是on-the-fly方式。

这些要求的理由是什么呢?你觉得用了ADMM精度就不行了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-22 22:13:23 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2023-8-22 15:50
这些要求的理由是什么呢?你觉得用了ADMM精度就不行了?

我一般是OT和ADMM同时用或同时不用。
但我需要空轨道信息,所以这两个都不用。

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