计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 778|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 关于惯性矩张量的计算

[复制链接 Copy URL]

19

帖子

0

威望

269

eV
积分
288

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我在尝试做转动惯量的计算,分子坐标
C                 -0.41853400   -0.25710000   -0.00011100
H                 -1.53291100    1.05834600   -0.00007800
H                 -1.51065200   -0.29046800    0.00041500
O                  0.69434600    0.09684000    0.00004100

使用的原子质量(amu)依次为
12.000000, 1.007825, 1.007825, 15.994915


我计算的惯性矩张量(单位:amu*Angstrom^2)为
2.1571        -1.17395        -0.00050151
-1.17395        14.4816        -0.00020128
-0.00050151        -0.00020128        16.6387


使用的计算方法(http://sobereva.com/426),例
Ixx=12.000000*((-0.25710000)^2+(-0.00011100)^2)+1.007825*((1.05834600)^2+(-0.00007800)^2)+1.007825*((-0.29046800)^2+(0.00041500)^2)+15.994915*((0.09684000)^2+(0.00004100)^2)
=2.157098
Ixy=-(12.000000*((-0.41853400)*(-0.25710000))+1.007825*((-1.53291100)*(1.05834600))+1.007825*((-1.51065200)*(-0.29046800))+15.994915*((0.69434600)*(0.09684000)))=-1.173951
...


为了验证我的计算结果,使用Multiwfn_3.8_dev_bin_Win64(Last update: 2023-Aug-11)读取坐标的gjf文件,
100
21
all
输出的惯性矩张量为
**************** Moments of inertia tensor (amu*Angstrom^2) ****************
             1             2             3
     1  2.13852E+000 -1.25203E+000 -5.35965E-004
     2 -1.25203E+000  1.41835E+001 -1.92985E-004
     3 -5.35965E-004 -1.92985E-004  1.63220E+001


发现我计算的结果偏差有些大,将惯性矩张量矩阵元素做一个比值(我的计算结果/Multiwfn3.8dev)为
1.00869        0.937638        0.935714
0.937638        1.02102        1.04298
0.935714        1.04298        1.0194


请问,我是哪里计算出错了吗?感谢!




5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112500

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-8-12 04:54:12 | 只看该作者 Only view this author
文中公式里的x、y、z是相对于质心的。否则转动惯量就依赖于原点的选取了
另外,Multiwfn计算时用的是丰度平均的元素质量,不是丰度最大的同位素质量。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

19

帖子

0

威望

269

eV
积分
288

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-12 05:26:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 13799725819 于 2023-8-12 05:47 编辑
sobereva 发表于 2023-8-12 04:54
文中公式里的x、y、z是相对于质心的。否则转动惯量就依赖于原点的选取了
另外,Multiwfn计算时用的是丰度 ...

感谢Sob老师的解答,
我将分子中原子坐标同时减去质心坐标,再次计算惯性矩张力,得到的结果和Multiwfn3.8dev就一致了:
(我的计算结果(原子质量使用最大丰度的)/Multiwfn3.8dev)
0.999631        0.998836        0.998829
0.998836        0.999644        0.998677
0.998829        0.998677        0.999643

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 14:53 , Processed in 0.207555 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list