计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 24983|回复 Reply: 14
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 高斯OPT=Tight Int=ultrafine与单纯用OPT区别大吗?

[复制链接 Copy URL]

76

帖子

0

威望

1160

eV
积分
1236

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
在用高斯优化分子基态构型时,选用关键词OPT=Tight Int=ultrafine与单纯用OPT区别大吗?哪个更好呢?是否可以用前者优化基态构型?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112482

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2016-7-20 10:09:34 | 只看该作者 Only view this author
一般就直接opt就完了,仅当你对结构精度要求高(比如优化N2二聚体这种相互作用很弱势能面很平缓的体系),或者优化出来之后做freq又出现NO或小虚频的时候才需要opt=tight int=ultrafine重新做更精确的优化,见
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278

绝大多数情况,opt和opt=tight int=ultrafine优化出来的结构定量差异微乎其微,肉眼绝对看不出差异来。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1294

帖子

0

威望

6236

eV
积分
7530

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2016-7-20 10:13:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-20 10:09
一般就直接opt就完了,仅当你对结构精度要求高(比如优化N2二聚体这种相互作用很弱势能面很平缓的体系), ...

sob老师好,我用这个opt=tight int=ultrafine优化出来还是有虚频,怎么办呢?谢谢老师
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

strive for greatness

76

帖子

0

威望

1160

eV
积分
1236

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-20 11:06:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-20 10:09
一般就直接opt就完了,仅当你对结构精度要求高(比如优化N2二聚体这种相互作用很弱势能面很平缓的体系), ...

非常感谢Sob老师,因为我计算的这个分子较大,为了避免小虚频的出现,我直接采用OPT=Tight Int=ultrafine进行基态优化,然后再进行频率验证可以吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112482

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2016-7-20 13:08:24 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2016-7-20 10:13
sob老师好,我用这个opt=tight int=ultrafine优化出来还是有虚频,怎么办呢?谢谢老师

calcall
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112482

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2016-7-20 13:08:36 | 只看该作者 Only view this author
石头 发表于 2016-7-20 11:06
非常感谢Sob老师,因为我计算的这个分子较大,为了避免小虚频的出现,我直接采用OPT=Tight Int=ultrafine ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

41

帖子

0

威望

2566

eV
积分
2607

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2016-7-20 14:08:10 | 只看该作者 Only view this author
opt 默认是tight 吗?
http://pymol.chenzhaoqiang.com/index.html

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2016-7-20 14:24:01 | 只看该作者 Only view this author
数据挖掘 发表于 2016-7-20 14:08
opt 默认是tight 吗?

RTFM

76

帖子

0

威望

1160

eV
积分
1236

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-20 15:17:16 | 只看该作者 Only view this author

好的,非常感谢Sob老师

139

帖子

1

威望

1416

eV
积分
1575

Level 5 (御坂)

10#
发表于 Post on 2016-7-20 16:43:23 | 只看该作者 Only view this author
数据挖掘 发表于 2016-7-20 14:08
opt 默认是tight 吗?

没有 默认就是opt; scf默认才是tight

41

帖子

0

威望

2566

eV
积分
2607

Level 5 (御坂)

11#
发表于 Post on 2016-7-20 21:09:10 | 只看该作者 Only view this author
KiritsuguPapa 发表于 2016-7-20 16:43
没有 默认就是opt; scf默认才是tight

谢谢
http://pymol.chenzhaoqiang.com/index.html

41

帖子

0

威望

2566

eV
积分
2607

Level 5 (御坂)

12#
发表于 Post on 2016-7-20 21:09:19 | 只看该作者 Only view this author
http://pymol.chenzhaoqiang.com/index.html

174

帖子

0

威望

1107

eV
积分
1281

Level 4 (黑子)

13#
发表于 Post on 2023-9-14 16:14:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-20 10:09
一般就直接opt就完了,仅当你对结构精度要求高(比如优化N2二聚体这种相互作用很弱势能面很平缓的体系), ...

老师,如果整个反应路径只有一个过渡态结构加了int=ultrafine,当我比较自由能时,可以直接使用自由能的热力学校正量+溶剂下的单点能进行比较吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112482

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2023-9-14 19:02:25 | 只看该作者 Only view this author
火星哥 发表于 2023-9-14 16:14
老师,如果整个反应路径只有一个过渡态结构加了int=ultrafine,当我比较自由能时,可以直接使用自由能的 ...

自由能该怎么算怎么算,是另一码事
几个结构的自由能横向对比时,其中用的单点任务的积分格点必须统一。至于opt freq部分积分格点不是必须统一。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

174

帖子

0

威望

1107

eV
积分
1281

Level 4 (黑子)

15#
发表于 Post on 2023-9-14 21:18:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-14 19:02
自由能该怎么算怎么算,是另一码事
几个结构的自由能横向对比时,其中用的单点任务的积分格点必须统一。 ...

谢谢老师。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 17:41 , Processed in 0.169517 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list