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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 分子动力学模拟时，平衡结果出现水分子消失现象
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[GROMACS] 分子动力学模拟时，平衡结果出现水分子消失现象

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Yaozhi_Yang

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楼主
发表于 Post on 2023-9-19 22:04:33 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
我在使用GROMACS对磷脂双层膜体系进行能量最小化后，紧接着进行了NVT下的平衡模拟，但模拟结果表明，水分子出现消失，如下图所示

图中，红色代表水，可以看到水缺失，
请教各位这是什么原因导致的？
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