计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13529|回复 Reply: 20
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 对于多步反应反应速率常数的计算问题

[复制链接 Copy URL]

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 huyongxin 于 2020-3-12 18:38 编辑

我最近在计算反应速率常数问题上遇到了一些问题,对于一个中间有复合物生成的反应:A+B-----Complex--------C+D,一般只计算Complex------C+D的反应速率常数,以此为决速步近似为总反应速率常数。
那如果想要计算A+B-----D+E的速率常数应该如何计算呢?我没有找到相关的文献,希望各位大佬可以解惑,或者推荐我几篇相关的文献。
对于A+B+C----Complex1+C-------Complex2-------D+E 这样的反应又应该怎么计算呢?

补充一下:以上所说都是基于过渡态理论,使用阿伦尼伍兹公式计算速率常数。

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-3-12 17:04:45 | 只看该作者 Only view this author
“A+B-----Complex--------C+D,一般只计算Complex------C+D,以此为决速步近似为总反应速率常数”哪里说的?并不正确

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-12 18:37:56 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2020-3-12 17:04
“A+B-----Complex--------C+D,一般只计算Complex------C+D,以此为决速步近似为总反应速率常数”哪里说的 ...

在计算反应速率常数时,不是把这个反应看作单分子反应计算速率常数吗?

1102

帖子

18

威望

6643

eV
积分
8105

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

4#
发表于 Post on 2020-3-12 19:06:51 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2020-3-12 18:37
在计算反应速率常数时,不是把这个反应看作单分子反应计算速率常数吗?

A+B - > C+D 是双分子反应呀
Stand on the shoulders of giants

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-12 21:03:59 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2020-3-12 19:06
A+B - > C+D 是双分子反应呀

但是在反应的时候,他们两个形成了一个中间产物。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112469

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2020-3-13 03:34:31 | 只看该作者 Only view this author
分清楚过渡态理论和阿伦尼伍兹公式的关系
阿伦尼伍兹公式不是用来从头计算速率常数的,而只是给出k与T的关系而已,计算k是通过过渡态理论得到的,看
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html

如果A+B-----D+E是基元反应,就按照上文说的做法,当双分子反应用过渡态理论算就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-18 20:45:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-13 03:34
分清楚过渡态理论和阿伦尼伍兹公式的关系
阿伦尼伍兹公式不是用来从头计算速率常数的,而只是给出k与T的关 ...

感谢sob老师的解答。
那对于非基元反应的两步或者三步反应的总速率常数应该怎么计算呢?
sob老师知不知道一些相关的文献呢?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112469

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2020-3-19 21:13:06 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2020-3-18 20:45
感谢sob老师的解答。
那对于非基元反应的两步或者三步反应的总速率常数应该怎么计算呢?
sob老师知不知 ...

看决速步的k
这里提了
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-20 19:20:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 huyongxin 于 2020-3-20 21:08 编辑
sobereva 发表于 2020-3-19 21:13
看决速步的k
这里提了
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生

嗯,sob老师,我已经知道了决速步的k应该如何计算了。
但是目前有一个问题是,两条反应路径的决速步是一样的,但是决速步的前一个步骤是不同的,所以我想计算反应总的速率常数,而不是只看决速步的k。
这个问题有没有什么办法呢?
如果一个反应由两个基元反应组成中反应速率是不是可以写成1/k=1/k1+1/k2

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112469

管理员

公社社长

10#
发表于 Post on 2020-3-22 15:34:41 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2020-3-20 19:20
嗯,sob老师,我已经知道了决速步的k应该如何计算了。
但是目前有一个问题是,两条反应路径的决速步是一 ...

决速步的k对总反应速率占绝对主导,即便之前有的步骤的k不同,一般也不显著影响整个表观的k。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-23 19:43:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-22 15:34
决速步的k对总反应速率占绝对主导,即便之前有的步骤的k不同,一般也不显著影响整个表观的k。

好的,非常感谢sob老师。

61

帖子

0

威望

351

eV
积分
412

Level 3 能力者

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-16 18:43:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-22 15:34
决速步的k对总反应速率占绝对主导,即便之前有的步骤的k不同,一般也不显著影响整个表观的k。

sob老师,我最近又看了一下你的帖子,如果两个分子在反应的时候形成了一个比较稳定的复合物,那么应该用单分子反应的公式来计算速率常数。但你您的帖子里又说:
”值得注意的是,在计算双分子反应的自由能垒时(为讨论简便,假设是基元反应),反应物的自由能在计算时应当是用两个分子孤立状态下算的自由能加和来得到,而不应当是对反应复合物来计算自由能。因为这样得到的自由能才适合代入TST公式里得到能与实验相对应的k。“
为什么这样得到的自由能垒适合带入TST公式呢?
到计算的时候是当作单分子反应计算还是双分子计算?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112469

管理员

公社社长

13#
发表于 Post on 2020-5-17 04:03:31 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2020-5-16 18:43
sob老师,我最近又看了一下你的帖子,如果两个分子在反应的时候形成了一个比较稳定的复合物,那么应该用 ...

我那么说的前提是并不形成能长时间存在的很稳定的复合物,若形成了这种复合物本来就不应当简单当做双分子反应考虑
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

206

帖子

0

威望

4135

eV
积分
4341

科音成员

14#
发表于 Post on 2020-5-17 04:45:33 | 只看该作者 Only view this author
建议把物理化学的化学动力学基础理论部分好好再看一下,这应该都是最基本的知识没理解透彻

101

帖子

0

威望

1732

eV
积分
1833

Level 5 (御坂)

15#
发表于 Post on 2023-9-19 20:15:08 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2020-5-16 18:43
sob老师,我最近又看了一下你的帖子,如果两个分子在反应的时候形成了一个比较稳定的复合物,那么应该用 ...

请问您单分子反应速率常数的单位是/s吗?和双分子的反应速率常数单位不一样

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 15:32 , Processed in 0.786243 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list