GROMACS的gmx current指令计算聚合物静态介电常数是否合理？

liu840397562

请问老师同学们，有无使用gromacs做一些聚合物的介电常数模拟的，为何我通过gmx current指令计算聚合物介电常数总是只得到了1.1多或1.2多的介电常数，这与实际差距极大（正常应为3~4），据了解gromacs的计算公式和MS应该一致，均为如下图所示，但MS得到的结果却合理很多，均有~3接近实际，因此有如下问题：
1. 这难道只是由于GAFF和CompassII力场引起的巨大差异？
2. 难道是计算时候要在加电场的条件下模拟？（我没加电场...）
请各位老师同学赐教。

Nkki

同学你好，我也在计算聚合物的介电常数，能否和你交流学习一下

Nkki

Nkki 发表于 2024-6-24 12:13
同学你好，我也在计算聚合物的介电常数，能否和你交流学习一下

我用MS计算介电常数，也是用你上面提到的那个公式，得到的结果总是和别人差很多。