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[GROMACS] 请教gromacs选择amber力场后报错Atom CD in residue HYP 2 was not found in rtp...

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请教各位大佬,应该怎么解决

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这样的错误

这样的错误

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但是我在amber的文件HYP里没有找到CD

但是我在amber的文件HYP里没有找到CD

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2#
发表于 Post on 2023-10-22 02:28:54 | 只看该作者 Only view this author
pdb/gro文件里HYP残基有叫CD的原子,但rtp文件里HYP残基定义里没有叫CD的原子,对不上。弄清楚CD是什么,结构文件里该改原子名改原子名,跟rtp文件里对应上
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