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[综合交流] 分子结构优化后生成不了prm文件该怎么解决?

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楼主
本人进行分子结构优化,这个分子结构优化成功了却生成不了prm文件,有没有人能帮我一下啊 呜呜,
优化后的结果以放入附件中,我是CHARMM 36 力场的

麻烦大家教我一下怎么解决这个问题

HQS.out

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发表于 Post on 2023-6-30 18:07:30 | 只看该作者 Only view this author
生成prm文件的方法不是唯一的,必须详细列出你是怎么生成的prm文件,并且给出完整的报错信息,我们才能回答
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-30 18:37:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-30 18:07
生成prm文件的方法不是唯一的,必须详细列出你是怎么生成的prm文件,并且给出完整的报错信息,我们才能回答

啊,我们现在就是不会生成prm文件,不会方法,所以才来咨询一个方法,我们用过CGENFF 网站,生成不了 ,想问问还有其他方法吗,感谢感谢

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发表于 Post on 2023-7-1 02:27:27 | 只看该作者 Only view this author
xuyangyang 发表于 2023-6-30 11:37
啊,我们现在就是不会生成prm文件,不会方法,所以才来咨询一个方法,我们用过CGENFF 网站,生成不了 , ...

你还是没有回答我的问题。用CGENFF网站生成的时候,CGENFF网站具体报错的信息是什么?搞不好改一个什么设置就可以让CGENFF网站成功生成prm文件,但是你必须给CGENFF网站的报错信息,我们才能知道需要改什么。如果碰了壁不问原因就换路线,那科研永远也做不出来,因为再顺的研究路线也会有碰壁的时候。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2023-7-1 07:04:49 | 只看该作者 Only view this author
看清楚板块再发贴,分子模拟问题别发到量子化学版块
这次给你移动了,以后注意!

认真把此文看了,把关键性信息补充,否则等于完全无效的提问,提问时要有点最基本的逻辑
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2023-10-31 00:13:54 | 只看该作者 Only view this author
使用cgenff_charmm2gmx_py3_nx2.py这个脚本就可以对CGenFF产出的.str文件做出.prm文件了

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