羧酸根被质子化的能量变化如何求算？

霜晨月 · 发表于 Post on 2023-11-2 11:51:09

研究多步反应的反应机理时，比如A->B这一步，产物B的羧基是羧酸根负离子RCOO-；下一步B->C，反应物B是未解离的RCOOH形式。那么，画自由能折线图的时候，可以认为这两步的B能量相等吗？（即忽略羧酸根被质子化的能量变化）
我见有些文章是这样做的，不知道是否可行？如果不严谨的话，这个质子化的能量变化应该怎么求才合理？
（反应体系为中性水溶液，我尝试用RCOO- + H3O+ --> RCOOH + H2O 计算自由能变，感觉数值太负；用RCOO- + H2O --> RCOOH + OH-来算，又太正了；好像都不太合理）

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-11-2 17:46:33

不能。按RCOO- + H3O+ --> RCOOH + H2O或RCOO- + H2O --> RCOOH + OH-算都行，但是算完以后要按溶液的实际pH，对H3O+或OH-做浓度校正

霜晨月 · 发表于 Post on 2023-11-3 08:30:33

wzkchem5 发表于 2023-11-2 17:46
不能。按RCOO- + H3O+ --> RCOOH + H2O或RCOO- + H2O --> RCOOH + OH-算都行，但是算完以后要 ...

谢谢王老师。
这种情况有必要用水分子做显式溶剂化吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-11-3 13:59:42

霜晨月发表于 2023-11-3 01:30
谢谢王老师。
这种情况有必要用水分子做显式溶剂化吗？

按https://mattermodeling.stackexch ... -molecule/9482#9482的方法处理

霜晨月 · 发表于 Post on 2023-11-3 15:40:39

wzkchem5 发表于 2023-11-3 13:59
按https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/9480/is-it-possible-to-calculate-the-pka-valu ...

多谢多谢，学习了

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[综合交流] 羧酸根被质子化的能量变化如何求算？